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原来，白文选到安隆迎永历时，只带去少数兵丁，他的大部人马都在驻地，后来他被孙可望扣作人质，便秘密和好友马进忠进行联系，待孙可望发兵，便带上自己的人马跟随而来，于是便有了上面的一幕。可以设想，要是没有白文选和马进忠，战局的发展就很难预料了！
孙可望逃出几十里，回头一看，跟随他来的只有他的本部人马，且已损折大半，溃不成军。他不敢停留，星夜兼程逃回贵阳。到得城外，城门紧闭，连忙命人叫门，突然城头竖起一面旗子，上书“明庆阳王冯”，原来是冯双礼，他站在城楼上，大声说：“我已归顺大明，永历帝封我为庆阳王，命我守此！你若是投降，就立即下马，放下武器。你若攻城，就攻罢，叫你片甲无存。”
孙可望这才明白，原来留守城中的冯双礼，一转身就变成永历帝和李定国的人，端了自己的老窝。他气得咬牙切齿，恨不得把个冯双礼碎尸万段，但看看自己手下的这些兵将，十万人啊！十万人马，不乏饶勇之将，善战之兵，可是一战下来，或倒戈，或被俘，或战死，或打散，只剩下这数千人，已是劳顿不堪，溃不成军，这点点本钱怎能和勇将冯双礼来摊牌？只好忍气吞声，好话求和，说：“兄弟！你我共事多年，看在……”
“不要再说了！”冯双礼打断他的话，“看在多年的情份上，我放你一马，走吧！”
孙可望再哀求说：“兄弟，我妻儿还在城中，我唯一的要求是请你把她们还给我。”
冯双礼答应了他。命人把孙可望的妻妾老小带来，把城门打开一缝，让她们一个跟着一个的鱼贯而出，然后立即关上城门。孙可望一看，妻妾儿女佣人一个不少，只是财物一点也没带出来。他的妻儿围着他哭作一团，他看着城楼呆了好大一会，长叹一声，只好带着众叛亲离的的悲哀凄凄而去。
这一战，李定国不仅打败了孙可望，而且壮大了队伍。他们原来进入云南的人马，除孙可望一部以外，其他各部，包括白文选、马进忠、冯双礼等都归了他，近十万人，一时军威大振，浩浩荡荡凯旋而归。
永历闻报，大喜过望，带上随员出城迎接。
其实，永历帝也并非如大清的御用文人笔下所描述的那样，是个昏庸无能的残国小君，苟且偷安的懦弱之辈。尽管他也像前几位南明帝王一样是被故明势力拥戴上来的残国之君，而不是夺兵而出号令天下的有为之王，他的一切都得由拥戴他上来的人来做主，来安排，凡事由不得他。在安隆的几年时间里，他名义上是个帝王，实际上只是孙可望手中的一张牌，一张对残明的其他势力“挟天子以令诸侯”的王牌。为此，孙可望生怕他被人劫走，或被杀，或逃亡而失去这张王牌，对他採取了严格的“保护”措施。特别是孙可望发觉永历欲摆脱他曾下密旨召李定国而被他镇压后，对他的控制就更加严密也更加苛刻了，包括膳食钱每月给多少，其中皇帝多少，皇后多少，太后多少，太子多少，其他人员多少等等，都有严格的规定，事无巨细都得由孙可望来作安排。由此可见孙可望等对永历的控制到了何等到地步？对于永历来说，其实就是软禁，与囚犯无异，他不仅没有半点的自由，更说不上自主，连生活也难于保障，孙可望给他的膳食钱本来就少得可怜，往往还被拖欠，被克扣，有时还拿不到，经常吃了上顿没下顿，有时只能喝点稀粥，过得十分的艰难。在这种情况下，纵使他有一些抱负和才能又如何得以发挥呢？
到了云南，环境有了一些改善。李定国等尊他为正统之君，闽南的郑成功也派人来到云南奉表尊他为帝，使他得到了尊重，恢复了一些帝王的尊荣，成为抗清复明的一面旗帜。在此基础上，也有了一些自主的权力，可以按照自己的想法做一些自己能做的事情。
永历稍事安定便着手治理朝政，重建他的已被反复破坏的王朝体制。除了在梧州封李自成大顺军余部李过为邓国公、高一功为勋国公等等，在安隆封李定国为晋王、刘文秀为蜀王外，又封白文选为巩昌王、冯双礼为庆阳王，其余人员皆有所封。原大明朝的一些旧臣也闻讯投奔而来，如沐天波、杨畏知等，或袭旧职，或另有所封。是时，张煌言淅东兵败，他所拥戴的鲁王朱以海也被清军所杀，他便和郑成功联手共同抗清，尊永历帝为正统。永历又派出使臣从海路（陆路已被清军占领）绕道去传旨，封郑成功为延平郡王招讨大将军、张煌言为兵部尚书兼东阁大学士。从封爵上也可看出，永历对沿海的抗清复明是寄予很大希望的。
与此同时，他极尽努力做了一些安抚民众，稳定社会，鼓励生产，恢复教育的工作，使百废待兴的滇中民众在饱受长期的战乱之苦后得以休养生息。
孙可望入滇做的第一件事情就是毁掉滇中文化中心的文庙，大兴土木兴建专门用来供奉张献忠巨型塑像的“世庙”，极力宣扬张献忠，美化张献忠，把张献忠加以神化，奉为神明，不时的率领他的部众行大礼，表忠心，顶礼膜拜，还强迫民众瞻仰朝奉，山呼万岁，以此来继承和发扬张献忠大西政权的路线方针和各项政策，妄图借助张献忠的阴魂来稳固自己的统治。永历命人毁掉供奉张献忠塑像的“世庙”，不使其继续遗祸人间，标榜后世。
随之，又命人将孙可望毁掉的文庙按原来的规模进行重新修复，以恢复和弘扬儒学圣教，恢复礼制，教化乡里，重振文明。永历修复的文庙在清朝年间又加以修葺完善，便是后来人们看到的昆明文庙。
本来，明朝是一个尊礼义，重教育的朝代，她的教育体制比较完备，学校教育比较发达，民间有遍布城乡的“私塾”，各地有乡里自办的“义学”，地方政府有官办的“书院”，京城有最高学府“太学”等等。这些发达的各级各类教育机构，在“传道、授业、解惑”，普及文化，培养人才中发挥了极其重要的作用，培养和造就了一大批众所周知的跨越时空的优秀人才，有力地促进了经济的繁荣和社会的进步，使大明王朝出现了近三百年的辉煌，成为当时的东方，也是世界上综合实力最为强盛，影响力最大的一个国家，对人类的文明进步作出了不可磨灭的贡献。明代的教育，即便是在远离中土的滇中，也是十分兴盛，人才辈出。但随着王朝的衰落，孙可望等的禍乱，闹得滇中生灵涂炭，民众离散，整个社会受到严重的摧残，教育也早已不复存在。在此情况下，永历命人加以修复，聘请教师，招收学子，想尽一切办法恢复教学，延续滇中教育。
当年还以教场为贡院，按明制开科举，先开云南乡试，第二年又开会试，先后取了一些考生，吸收了一些举子充实他的政权机构。
废除并销毁孙可望时期铸造和流通的“大顺通宝”“新朝通宝”等钱币，恢复使用大明制币，包括曾经短期发行过的“弘光通宝”“隆武通宝”，还加铸了“永历通宝”。这“永历通宝”流传到郑成功控制的沿海一带（郑成功到台湾后也铸造“永历通宝”，流通了很长一段时期）。
接着，永历又在五华山把毁坏的府院拆除，重新修建宫殿。
连年的祸乱，滇中已经闹得山穷水尽，官民人等连衣食都难以为继，再也拿不出经费来修筑宫殿。于是，永历便採纳臣僚们的建议，命人到附近的昆阳、呈贡拆衙署、豪宅上的建筑材料，运到昆明建盖宫殿。是时，由于沙定洲作乱，孙可望之流的大屠杀，有的地方甚至遭到反复屠杀，滇中官民或被杀，或逃离家园流落他乡，其中不少流向滇西、滇南偏僻之地，有的甚至远走交趾等东南亚国家，许多的城镇如昆阳、呈贡城中的房屋多已人去楼空，荒芜败落，成了虎豹出没之地，雉兔往来之乡。这样，便可以哪里无人拆哪里，哪间完好拆哪间，到也方便顺手。
这样，就在李定国大败孙可望凯旋归来不久，永历的宫殿也拆建完毕，御驾入内。他的后宫也得到了一些充实。本来，永历的眷属宫人在逃离肇庆时大多为清军所杀，逃至广西桂林的又被孙可望所杀，跟随他从安隆来的就只有他的母亲太妃王氏和皇后、太子、一个伺候他饮食起居的次妃，还有少数的宫女、太监。迁入五华山宫殿后，他的近臣马吉翔、李国泰等商议给他选淑女，充实三宫六院，像像样样的做皇帝。他拒绝了，说：“山河破碎，强敌当前，我一个逃亡之君，能像现在这样就知足了，哪还敢有更高的奢望。再说这滇中也是久经战乱，民穷财尽。算了吧！”
马吉翔等说：“皇上，这是前朝之制，不可废。再则，有晋王等护驾，可得太平。”
“不要烦我！”永历这次腰杆硬了许多，不想再让他等摆布，头也不回的走开，说：“要做的事还多着呢。”
这事最后由永历的母亲太妃王氏出面解决，补充了几个宫女。
如此一来，永历帝在昆明五华山的住所俨然又是一个皇宫的样子，一个王朝的皇宫。不过，永历帝的昆明皇宫，跟本无法和崇祯帝的北京皇宫相比，也不能和弘光帝的南京皇宫相比，甚至还不如隆武帝的福州皇宫，虽然同为皇宫，却有天壤之别。他的皇宫，不但规模极小，宫殿极简陋，后宫佳丽不多，而且朝臣也没几个，显得十分的寒碜可怜。似乎在映照着大明王朝的江河日下，气数日衰！
即便这样，永历帝也得到了不少的满足，不仅生活安稳，而且也有了一些帝王的尊荣，就这样苟安下来。这终究还是一个王朝，一个飘浮十年之久才得以落定下来的王朝，一个领土面积像火中燃烧的纸片一样行将灰飞烟灭的王朝的象征。
但，就是这样的一个王朝也好景不长。就在永历的宫殿草草建成，朝政体制尚不具规模，滇中民众还没有从连年战乱中喘过气来的时候，来自北方的铁蹄又风卷残云般席卷而来——永历王朝的厄运也降临了。
三
本来，清廷还无心南下，欲暂且放弃地处边僻的云贵一隅，让永历帝偏安一时。这其中的原因，并不是清廷不想要这些遥远偏僻的“不毛之地”，也不是一个气势如虹的胜利者对一个