实现，则厦门是根本重地，决不可轻易丢失。他建议郑成功应当驻守南澳，居中调度；而自请与各镇官兵南下，倘若望见孙可望、李定国的军队，再来请郑成功亲行。
郑成功感谢陈豹的好意，但他认为现在按永历皇帝的旨意发兵，虽越山逾海也在所不辞，决不能只顾个人的安危。他指示陈豹，仍然要固守南澳，倘若厦门有警，可火速前往救应。
左先锋施琅以足智多谋著称。他感觉到郑成功南下凶多吉少，不愿随行，便以夜梦不吉为由请求留守，郑成功虽爱他之才，却没能力很好地驾驭他。又因为施琅喜欢背地里暗害别人，曾逼走了后劲陈斌，所以郑成功比较讨厌他。郑成功最后还是让他留守。并别任郑茂为左前锋，但心里已埋下了怀疑的种子。
顺治八年（公元1651年）二月，南下的船队行至白沙湖，遇到大风暴，船队受到一定损失。风暴过后，船队重新集结，继续前进。三月，船至天星所，迎面碰上清军从惠州来增援的乌尾船10余只。郑成功以两路迎击，从水路上截击惠州来的清军，以陆路攻打天星所。两路军队英勇出击，大获全胜。
部队正要乘胜前进，突然传来厦门失陷的消息。原来，郑成功出师南下以后，情况被清军侦察得知。当时在泉州的清朝福建巡抚张学圣，与驻守泉州中路总兵马得功、泉州道黄澎商议，决定进攻厦门。参加这次行动的还有漳州守将王邦俊。
马得功等统辖骑兵，先从五通渡海。他们胁迫澄济伯郑芝豹出船载渡。郑芝豹因为郑芝龙被扣留在北京，无奈，只好按马得功等人的要求办。
清军冲上厦门，守在那里的前冲镇阮引、后冲镇何德等水师，见清军来势甚猛，又有郑芝豹的船队帮助渡海，觉得抵挡不过，不战而逃。而负责留守的郑芝莞，听说清军已经杀过岛来便手忙脚乱，早就忘了守备之责和郑成功之托，连忙搜捡珍宝，席卷而去。他与亲信弃城下船，逃之夭夭。这时岛上一片混乱，如同鼎沸一般。
郑成功之妻董氏怀抱祖宗神主带儿子郑经跑到海滨，见岸边有船，便招呼说：〃我董夫人也 。〃舵工让她上了船，她命舵工把她泊近郑芝莞的船。郑芝莞见了董夫人，怕露了马脚，说他的船是战舰，不便乘坐，请她到家眷船中。董夫人说 ：〃媳妇喜乘此船，今征战时候，非此船不可 。〃这样，董夫人手抱神主，与郑经一起坐在这条载满财物的船上。神主是郑氏的一族所系，而满船的财物则是郑氏多年的积累，它不仅是家产也是郑军给养基础。
清军攻入厦门，郑成功储存的几十万斤大米，90万两黄金，几百镒珠宝被掳掠一空。
张学圣与严黄村、张效龄督率大队人马准备入厦门，刚好赶上大海涨潮，他见厦门孤岛非容大兵之地，便率人返回驻地。马得功见后军已撤，便不敢在厦门坐镇，在回撤中与郑鸿逵回防队伍相遇，双方发生激战，马得功占了上风。后来施琅率队进攻，马军有所退却。
马得功见很难杀出郑军防线，便心生一计。他派人驾小船去见郑鸿逵。马得功曾是郑鸿逵标下的守备，他利用这一层关系，派人传话说 ：〃虽然彼此间隔，不过是因为各司其职，但无时不挂念您。如今得功奉令过岛，未曾扰一草一木，奈欲退无舟可渡，得功必死于此。得功死分所当然，但就恐怕岛上人民因此就不能保全了。而且您的兄长在京，眷口在安平，其能安乎？不如宽得功夫片刻，假渡而归，一举两得，得功幸甚，即您也幸甚 。〃马得功的话软中带硬，郑鸿逵权衡再三，还是决定放马得功一条生路。他故意放松高崎的防守，并借给马得功几只渔船，渡马得功的军队回泉州。
郑鸿逵派人飞报郑成功，恳求班师回厦，拯救岛上百姓。
郑成功率部此时正在大兴所。他本来不想回师，要奉勤王大义为先。怎奈消息传入军中，军营内外一片哭声，他们担心岛上家眷的命运。军心不稳则难于继续南下勤王，无奈，郑成功回师厦门。
四月初一，郑军已到达厦门中左所，停泊在浯屿。但岛上出奇地平静，清兵早已于几天前就离开了厦门。
郑成功听说清军离开厦门竟是叔父郑鸿逵所助，大为愤怒，拔刀自断其发，发誓一定要杀尽清兵。郑成功下令不许郑芝莞与郑鸿逵与各亲属相见。他说：〃渡清兵而来的，渡清兵而去的，弃城送给清兵的，都是郑家的人，厦门遭殃，与清兵有什么关系呢 ？〃意指是郑家自已的人害了厦门。
郑鸿逵派人请郑成功进城， 郑成功不同意， 他说：〃叔父与清军通好，请我回城好像并没有什么好意。我不杀尽清兵，我们是没有相见的日子的 。〃郑成功又下令所有的镇将一律不许到郑鸿逵衙署去。郑鸿逵也知道帮助清兵的过失，脸上无光，难平郑成功之愤，便将军队带出厦门，移驻金门的白沙屯，并写信向郑成功解释原因。
郑成功移驻厦门港，召集诸将评议厦门失守的功罪。对勇于与清兵作战的，皆给予赏赐，对于弃城而逃的郑芝莞，按军令处斩，另外又杀了阮引，棒打了何德。
对于郑成功不徇私情，严明执法，又奖惩分明，将士无不心服，郑军的纪律也更加严明了。
郑成功为稳定厦门局势，将郑芝莞所运载的金银财物做为军饷，并加强防御工事建设，分别调拨劲旅把守。这样，岛上人心大定，秩序井然，兵坚防严。
郑鸿逵见郑成功在岛上处置有方，指挥得宜，庆幸郑家的事业有了出色的继承人，便把自己的船只兵权都交给了郑成功，自己则在白沙屯择地筑寨，广构亭沼，艺花植木，笙歌自娱。郑成功又重新部署了一下兵力，移驻于金门后埔扎营操练。
至此，郑成功控制了郑氏的全部兵权，东南沿海的郑氏部队都统一在了郑成功的旗下。在此后相当长时期内，金厦一直是郑成功抗清的坚强基础，更大规模的抗清斗争即将开始。
郑成功日夜操练兵马，囤集军饷，各项事务都已走上轨道。但一向号称知兵善谋的施琅却心怀贰志。
由于施琅曾暗中诬告过别人，又在南下勤王时托辞不出征，引起了郑成功的怀疑。在这之后，施琅因为郑成功没有提拔他，便不听从郑成功的命令，甚至公开与郑成功做对。
郑成功不露声色，但他已感到施琅桀骜不驯、离心离德，将来必成祸患。
五月二十日，郑成功下令在船兵将准备出军，各镇将提调其所辖部下，命人持令箭催促施显贵到厦门。
施显贵到厦门后即被囚禁。并命人到施琅家捉拿了施琅，也软禁了施琅的父亲施大宜及其家属。
施琅被关押在船上，使用诡计骗过了看守的人，几经周折，在亲戚的帮助下逃往内地。
郑成功得知施琅逃脱后顿足而叹 ：〃唉！吾不幸结此祸胎，贻将来一大患！〃这话不幸言中，施琅终于投靠清廷与郑氏为敌，那是后话了。
郑成功清理了内部之后，着手扩大抗清基地，督师在海澄磁灶地方，以待战机。
这时，清朝漳州总镇王邦俊率领海澄马军、步军数千人，也来到磁灶扎营，与郑军对垒，企图打击郑军的发展势头。
郑成功与诸将分析，打败漳州这一路兵马，会震慑清军，又能促进集兵征饷，鼓舞将士的抗清热情。
郑成功布置了具体的作战方案，等待时机发动攻击。郑成功布下了一个圈套，准备等清军进入后，正面进行猛烈攻击，尔后其他各路包抄而来，要一鼓作气把清军消灭。
果然，二十七日，王俊邦带兵进入郑军包围圈，被郑军一鼓作气打得惨败，清兵死伤无数，丢下了大量的辎重马匹。
三天后，郑成功等回到厦门中左所，对参加这次战斗的人员论功行赏。一律按照此前颁布的《杀虏大敌中敌赏格》中规定的中敌赏格加以奖赏。
这是金、厦奠基后的首役，可谓旗开得胜，人心为之大振。由于郑成功事业有起色，一些旧部也相继归来。郑成功对此非常高兴，并对回归的人加以重用。
随着兵力扩大和作战的需要，郑成功进一步完善了军队的编制。他首先设立了礼、智、信、仁、义五营，又设立了英兵、游击、奇兵、殿兵、正兵五营。
此时同时，郑成功又委派郑启设置了军器制造局，督造军器。所造军器除刀枪等兵械外，还有藤牌、战被、火筒、火罐等。藤牌又称为团牌，是专为抵御满洲骑兵而设。做战时士兵三人为一伍，一兵执团牌，遮蔽两人，一兵砍马，一兵砍人。团牌兵攻击满洲骑兵甚为有效，对清军威胁很大。战被又称滚被，是一床厚二寸的大棉被，由一人携带，敌人射箭来，便张开棉被遮挡，箭射过后，便将棉被卷起滚进，同时挥舞双刀砍敌兵的人马之足。火筒是用来向敌兵喷射火焰的武器。火罐，其中装满火药，在点燃引信后投向敌兵，以杀伤敌人。郑军的武器比较先进，增强了抵抗清军的战斗力。
郑成功不断地派兵攻打清朝在福建的各个据点。不久，他占领了长泰、海澄、诏安、平和。
在作战中，郑军勇往直前，郑成功指挥若定，取得了一次又一次的胜利。每次战争之后，郑成功都按《大敌赏格》升赏杀敌有功人员，而对于临阵脱逃的，或在阵前就斩，或战后斩首。郑成功的赏罚分明，增强了将士们的凝聚力，使作战中的将士们奋勇杀敌，急立军功。
在郑军围攻漳州城时，固山金砺率兵来解围。郑军退守海澄。清兵炮击海澄数月，海澄城内一片废墟。在郑成功的鼓舞和指挥下，趁清兵进攻之时，顽强防守，又布地炮阵阻击清军回撤。清兵惨败而回。
郑成功自隆武二年（公元1646年）到顺治十年（公元1653年），在海上起兵初期的7年里，巩固了金、厦根据地，扩大了外围据点，占领海澄、长泰、漳浦、潮州、潮阳、惠来等城，壮大了实力，为大举北伐打下了基础。
清军以武力〃围剿〃收效甚小，便着重从政治上对郑成功实行诱降。
清朝政府先以被拘留的郑芝龙为人质，对郑成功进行了多次劝降、诱降活动，都遭到郑成功的拒绝。
见郑成功不肯就抚，清朝政府又宣布封郑成功为海澄公、郑鸿逵为泰化伯，郑芝龙为都督，郑成功仍没有归服之心，仍然高举〃杀父报国〃义旗，进行抗清斗争。
清政府见诱降不成，慑于郑成功对闽、浙的威胁，于顺治十二年（公元1655年），任命郑亲王世子济度为定远大将军，赶到福建进剿郑成功。郑成功以保全军队，以逸待劳为策略，来抵抗清军这次大规模的进攻。于十二月底，郑军打败了济度的军队，大振东南沿海抗清的热情。
郑成功率军经过多年征战，不断取得了胜利，成为反清复明斗争中力挽狂澜之师。他还要与其他抗清队伍联合，以图取得更大的抗清战果。
第四章 孤军荒野
郑成功率领郑家军进行顽强的抗清斗争，取得不断的胜利。南方逐渐形成了对郑成功有利的局势。郑成功兼蓄其他的抗清力量，发动了围攻金陵的战争，不幸遭到失败。清政府采取多种措施，要致郑成功于死地。郑成功的军队被�