寅、加行
由身、语做出破坏僧团的行为。
卯、究竟
将僧团中如法行持的僧众之一部分分裂到非法方面完毕。如《俱舍论》云：“忍异师道进。”指分裂后的僧团认可佛以外其它的导师及其道法。如此为究竟。
另外，若破羯磨僧，不犯五无间之根本罪，但犯支分罪。
五、出佛身血
子、基：化身佛。
丑、发心：（一）想：于基无误想。（二）发起心。发起杀害之心，并非打辱之心。
寅、加行：以种种方便进行杀害。
卯、究竟：使佛身体伤损出血。
若毁坏佛像不犯根本罪，但犯支分罪。毁佛像属于近五无间罪之一。《白莲花经》云：“佛陀幻化多种像，为利有情行善法。”《耳饰经》云：“末法五百世，我现文字相，观想彼为吾，尔时当恭敬。”经典的文字既是佛陀色身，也是法身舍利，若毁坏经典，罪过极重，犯近五无间罪之一。
第五根本罪：持邪见
即拔无因果等邪见。否定因缘果报，否定前后世等，属于持邪见。
子、基
（一）否定产生善恶果报之因为善业和恶业。（二）否定造业将来感受安乐或痛苦的果报。（三）否定存在前世与后世。如果安住在法界实相本性之中，这种观点不算邪见，但是，如果否认在世俗名言中存在善恶果报及前世、后世等，即犯根本罪。
丑、发心
（一）想。于基无误想。（二）发起心。发起否定善恶果报及前后世的恶劣用心。
寅、加行
口中讲没有善恶果报，没有前后世等。随讲基中三者之一为加行。
卯、究竟
（一）自心相续中产生邪见。在邪见产生的刹那即断善根，同时犯根本罪。（二）自作或教他作十不善业，则犯更严重的根本罪。
《集学论》云：“执持邪倒见。”为犯根本罪。《俱舍论》云：“唯邪见断善。”宗喀巴大师说：“故受行十不善及教他受行，非定须之支。”此说与洛钦大译师所说不同，宗喀巴大师所说之意为心相续生起邪见已断善根，已犯根本罪，无须再造十不善业。洛钦大师所说指由邪见而自作教他作十不善业，则严重违犯根本罪。《虚空藏经》云：“若谤无因果，不畏他世，自行十不善业或转教多人。身自坚住，教他坚住十不善业道，是名第五根本罪。”
壬二、大臣之五定罪
颂曰：舍宅村落乡镇城都市，
若毁则违大臣五定罪。
在印度，一家人所居住的处所为舍宅；四家族聚居之地为村落；有十八种工厂的地方为乡镇；有很多大商人聚集之处称为城；如王舍城等大城市为都市。
大臣易造之五定罪包括国王五定罪中前四种（除邪见外）以及摧毁舍宅等处所。
子、基
所毁坏的处所：舍宅、村落、乡镇、城、都市，五者中随一。
丑、发心
（一）想。于基无误想。（二）发起心。以嗔恚心等烦恼发起破坏彼处所之意乐。
寅、加行
以火等种种方便进行摧毁彼处所之行为。
卯、究竟
毁坏舍宅、聚落等。若毁坏处所的同时，致人死亡，及毁坏三宝财产等，属于其它的罪，此处只从毁坏处所方面讲。
如《集学论》云：“毁坏聚落等，佛说为本罪。”《虚空藏经》云：“若乐破坏国邑聚落舍宅人民，是名根本等罪。”毁坏国、邑、聚落、人民舍宅等，是大臣容易违犯的五根本罪之一。《梵网经》云：“若佛子！以恶心故，放大火烧山林旷野，四月乃至九月放火。若烧他人家屋舍宅城邑僧坊田木，及鬼神官物，一切有主物不得故烧。若故烧者，犯轻垢罪。”
壬三、初行住者之八定罪
颂曰：未修示空心愿声闻乘；
退失大心滋发小乘心；
令舍别解脱安立大乘；
执谓小乘不能断贪等，
以此摧毁彼乘所证果；
心存嫉妒自赞而毁他；
谋求名闻利养而自诩；
仗势治罚沙门勒索财；
禅修者财惠施读诵者，
令舍寂止初行八定罪。
普通初发心菩萨（初行住者）容易造此八种根本罪。如《虚空藏经》云：“复次善男子善女人初行住大乘者，有八根本罪。此初行住大乘者，于根本罪而有错谬，焚灭一切宿种善根，趣向恶道，堕他胜处，远离天人大乘等乐，久处轮回，离善知识。”八根本罪如下：一、对非法器说甚深法；二、遮止大乘；三、谤别解脱；四、谤声闻乘；五、自赞毁他；六、妄说上人法；七、取三宝物；八、立恶制等。
第一根本罪：对非法器说甚深法
颂曰：“未修示空心愿声闻乘。”非法器在此指已发菩提心但尚未以大乘法调伏自相续的菩萨，若对他宣讲甚深空性法，使他生起畏惧而退失大乘心。
子、基
（一）所对境。未善修心，但已发世俗愿行菩提心，由于未以大乘深广法调伏自己的心相续，故对甚深空性法产生恐惧。宗喀巴大师与洛钦大译师均认为，此限于自未审观法器。若已观察法器，自觉彼人堪为法器，然而实际非为法器，则不犯根本罪。
（二）所说法。宣讲甚深正法，指离一切戏论，没有任何承认的般若大空性法；或讲一切众生本具如来智慧德相，即便地狱、饿鬼、傍生等恶趣有情也恒时不离如来藏之功德妙用；或讲禅宗、密宗之见解，善业、恶业无利无害，五毒即是五智慧，苦谛即是大安乐的灭谛，佛与众生没有差别，均是大平等，大清净，具有自然本智。如上所说甚深之法。
丑、发心
（一）想。于基无误想。（二）发起心。具有未观察对境是否堪为法器而宣说甚深法要之发心。
寅、加行
自己口中宣说甚深广大之法句。
卯、究竟
闻者听说大空性等法，深生恐惧，退失大乘世俗菩提心，并发愿求自己解脱之声闻乘心。说法菩萨犯根本罪。如果听法者为具有行戒的菩萨，因闻空性法而生恐惧，退失世俗菩提心，该闻法菩萨也犯根本罪。
初行住菩萨在宣说法要之前应当观察弟子，让其一步一步地修行，逐渐深入，同时善加观察，然后宣讲与其法器相应之法。《集学论》云：“于未净修心，有情说空法。”为犯根本罪。《虚空藏经》云：“此诸众生因昔恶行，而生险难五浊恶世，以少善根近善知识，得闻甚深大乘经典，其人浅智即发阿耨多罗三藐三菩提心。而初行菩萨闻说甚深法宝经典，如其所闻受持读诵，为前浅智如实开示巧妙文义广大境界。彼愚夫异生闻如是说，心生怖畏。心怖畏故，即便退失阿耨多罗三藐三菩提心，发声闻乘心，是名初行菩萨第一根本罪。善男子，以犯罪故，焚烧灭一切宿世善根，趣向恶道堕他胜处，远离天人大乘等乐，毁菩提心。是故菩萨于他有情补特伽罗深心志愿，应先知己如心所行，随其渐次而为说法，譬如渐入大海。”
第二根本罪：遮止大乘
颂曰：“退失大心滋发小乘心。”故意劝已发大乘菩提心的修行人舍弃大乘，使他生起小乘心。
子、基
所遮境，为已趣向佛道者，即是已发菩提心入大乘道之人。
丑、发心
（一）想。于基无误想。（二）发起心。明知对境有情已趣向佛道，而故意遮止其入佛道之心。
寅、加行
遮止入大乘，故意说：你不能行六度到彼岸，不能成佛，当发声闻独觉乘心，能速脱生死。
卯、究竟
通过遮止，使彼人退失大乘菩提心，并发小乘心。
印度生慧论师所著的《入行论大疏》云：“若遮无上正等菩提，令他发起小乘之心，是名第二。”即第二根本罪。如《集学论》云：“已入佛乘者，遮止大菩提。”《虚空藏经》云：“复次初行菩萨发如是言，汝不能修习六波罗蜜行，亦复不能得阿耨多罗三藐三菩提，汝应速发声闻辟支佛心，汝可速得出离生死。乃至如前所说，是名初行菩萨第二根本罪。”其中“如前所说”，指“善男子，以犯罪故，焚灭一切宿种善根，趣向恶道堕他胜处，远离天人大乘等乐，毁菩提心。”《梵网经》云：“若佛子。心背大乘常住经律。言非佛说。而受持二乘声闻外道恶见。一切禁戒邪见经律者。犯轻垢罪。”又云：“若佛子护持禁戒。行住坐卧。日夜六时。读诵是戒。犹如金刚。如带持浮囊。欲渡大海。如草系比丘。常生大乘善信。自知我是未成之佛。诸佛是已成之佛。发菩提心。念念不去心。若起一念二乘外道心者。犯轻垢罪。”所以菩萨不能遮止他人趣入大乘，不能使他人退失菩提心而发小乘自度之心。自己也不能退失大乘心发小乘心。
第三根本罪：谤别解脱
颂曰：“令舍别解脱安立大乘。”指使他人舍弃小乘别解脱戒而安立大乘。
子、基
所对境为定性小乘根器者，正在如理修学小乘别解脱戒，或者尚未出家而欲学小乘法者。
丑、发心
（一）想。于基无误想。（二）发起心。没有特别的必要而故意发起诽谤别解脱之心。
寅、加行
宣说不必护持别解脱戒，当发大乘菩提心，诵大乘经，由此则因烦恼所作三业等一切恶行皆可获得清净。如此遮止别解脱及小乘发心。
卯、究竟
不但使人理解其所说义，而且让人舍弃小乘别解脱，安立大乘，如此为本罪究竟。如果仅仅遮止小乘为恶作罪。
生慧论师在《入行论大疏》中说：“令舍别解脱律，说惟发大乘心，读大乘经，便得清净，是名第三。”即第三根本罪。《集学论》云：“令舍别解脱，安立于大乘。”《虚空藏经》云：“复次初行菩萨作如是言，汝何坚持守护波罗提木叉13及律仪戒，应速发阿耨多罗三藐三菩提心，读诵大乘经典，若身、语、意所集烦恼，不善业报，悉得清净。乃至如前所说，是名初行菩萨第三根本罪。”
第四根本罪：谤声缘乘
颂曰：“执谓小乘不能断贪等，以此摧毁彼乘所证果。”执著小乘法不能断除贪等烦恼，否定小乘所证解脱果。
子、基
所谤境：声闻乘或缘觉乘，或总谤二乘。此处指二乘修行所得之证法。
丑、发心
（一）想。于基无误想。（二）发起心。执著声缘不能永断三有根本，故真实发起彼等也不能出离生死之心。所谓真实心指并非权巧方便或戏论，而是真实执著。
寅、加行
诽谤声缘乘不能断贪、嗔、痴等五毒烦恼，不能获得小乘出世的见道、修道智慧，或者得不到解脱的果位。三者随讲其一，即为犯根本罪之加行。
卯、究竟
他人已理解所说言语的意义，这时说者即犯根本罪，此为究竟。若听闻者为大乘初行住菩萨，信受诽谤者的见解，舍弃小乘法而不弘传，那么，听闻者也犯根本罪。
《集学论》云：“执谓有学乘，不能断贪等，亦令他受持。”为犯根本罪。《虚空藏经》云：“善男子，如能远离听受读诵声闻乘法，亦不为他人说此声闻乘法（指：汝应当远离声闻乘法）。（声闻乘）不能得大果报，不能永断烦恼。应信大乘经典，听受读诵为他人说此大乘经法，能令忏除一切恶道果报，速得阿耨多罗三藐三菩提故。如彼所言，取是见者二俱得罪。是名初行菩萨第四根本罪。”
第五根本罪：自赞毁他
颂曰：“心存嫉妒自赞而毁他。”以嫉