九年，对于“风”得到自在，证大印法性。于是渐次说法教化，八十四岁去世。继承教法的是岗薄瓦福宝，发展遍于全藏，称迦举派。
岗薄瓦福宝，将迦当派修菩提心教授与“迦举派”大印教授结合，名为俱生大印，传授门徒，成为达薄迦举系。
达薄的弟子迦玛巴都松钦巴（1110—1193），建迦玛寺（1159）和粗朴寺，弘传教法，成迦玛迦举系。达薄又一弟子帕摩主巴金刚王（1110—1170），建帕主寺（1158），成帕主迦举系。
帕主弟子凌惹（1128—1188）传藏巴贾惹（1161—1211），广弘大印教授于康藏各地，为主巴迦举系。
帕主又一弟子止贡宝祥（1143—1217），三十七岁（1179）住止贡寺广弘迦举教授，成止贡迦举系。
帕主又一弟子达陇吉祥德（1142—1210），三十九岁（1180）到达陇建寺弘法，成达陇迦举系。
此外，还有刹巴、跋绒、雅桑、缀朴等诸系，不能列举。总之迦举派中，系统最多，传播也最广，握地方政权的也很多。起初和萨迦派抗衡争权的有止贡系，其后由帕主系大悉都，尽夺萨迦政权，治理八十七年，称为盛世。到明宣德十年（1435），后藏仁绷巴善财在桑主则独立，前后藏政权分裂一百五十年。到嘉靖四十四年（1565），迦玛璀敦多杰又推翻仁绷巴而独立。这些都属于迦举派。到崇祯十三年（1640），固始汗进藏，尽取前后藏政权，迦举派才失掉政治势力。其各系教派的传承，到现在未曾断绝。
萨迦派“萨迦”是地名，因在此地建寺弘法。所以称为“萨迦派”。这一派的创始人是卓弥译师，特别崇尚的教授是道果教授。卓弥摄受弟子虽多，得圆满教授的不过几个人。昆宝王得其讲释经论的教授，继承其道果承传。
昆宝王（1034—1101）四十岁时建萨迦寺，弘法三十年，六十九岁去世。他的儿子萨勤庆喜藏（1092—1158），先从他的父亲得卓弥所传讲释经论的教授，后来从法然等学得卓弥所传的道果教授，成为卓弥教授的集大成者。萨勤住持萨迦寺四十八年，是萨迦五祖之首。称为“萨勤”，即萨迦五大喇嘛之意。其后法派相承，成萨迦派。
萨勤以后一百五十多年，世代相承，弘扬道果教授等显密教法。到帕思巴（1235—1280）十九岁时，元忽必烈从受欢喜金刚灌顶，进帝师号，以西藏十三万户为谢礼，西藏的教政全权，都为萨迦所有。管理政事的大臣，以后有童自在、菩提金刚、阿伽伦三个人，在这三人的时代，常与迦举派中的止贡寺众斗争。阿伽伦时并且曾邀元兵进藏，焚毁止贡全寺。此后内乱渐多，至正元年（1349）前藏诸区都被迦举派帕摩主巴系的大悉都菩提幢所占。又六年（1354），后藏地区，也都隶属悉都。萨迦的政权虽然失去，但其教法传承，到现在不见衰落。传授显密教法的大德，也遍布全藏。
觉曩巴“觉曩”是地名，因悲精进在其地建寺弘扬他空见，所以称为觉曩派。这派的创始人名叫不动金刚，起初是在家瑜伽师，出家后名叫信王，从迦湿弥罗国卓敦曩拉则学时轮和集密的经论教授。由修时轮金刚法，见色空的天身从内显现，又依《如来藏经》等说“一切众生皆本具相好庄严的佛身名如来藏”等，于是生起“他空见”。信王将这种见和时轮教授等传给他的儿子法自在，法自在传虚空光，虚空光传虚空幢，幢传慧光，都对于时轮教法十分珍秘。慧光以下，弘传渐广。慧光传法身光，法身光传悲精进。悲精进建觉曩寺，传胜者智，胜者智传功德海，功德海传慧幢，慧幢著《了义海论》等，广弘他空见，于是形成觉曩派。
悲精进是帕思巴的弟子，所以觉曩寺也是萨迦的属寺，住持大德也都是由萨迦学成后转入觉曩派的。
明朝末年，有一位名叫达惹那他的出家人，以当时执政权的迦玛敦迥旺薄为施主，建达敦彭磋陵寺，弘宣他空见，盛极一时，很敌视黄教。不久，迦玛失位，该寺黄力也逐渐衰微。五世达赖时，将该寺改为黄教属寺，易名嘎登彭磋陵。其他如却陇降则等觉曩派寺院，也都改属黄教。现在西康藏塘地区，还有慧幢弟子宝祥所建的寺院，讲觉曩派的他空见。卫藏地区，早已没有弘传觉曩派他空见的寺院了。
其他教派（1）希结派，“希结”是能息灭的意思，就是说依据这个教授，能息灭业力或非人损恼所致的身心众苦，所以名叫“希结”。其教授内容，就是依般若空义对治我执烦恼，加上密法的观想，和修自他相换的菩提心力，来息灭惑业苦等。这个教授由印度帕荡巴桑结传来，初期传喀伽若那姑赫拉，由翁薄译师翻成藏文的有“息灭灯”和“大威德”等教授。中期传玛法慧、梭穹僧然、岗智幢等。其教授通括显密法门，数量很大。后期传荡巴卡勤、卡弯、班卓达、荡巴滚嘎等，其内容为“大印无垢点行持”。从此三期所传的般若波罗蜜多教授，名希结派。
（2）觉宇派，“觉”是“能断”义，就是说修这派教授，以慈悲菩提心能断自利心，以般若空见能断我执。此二种和合，能断四魔。又作“决”，是行义，指修菩萨方便般若行。
这一派也从帕荡巴桑结传来。帕荡巴中期传法时，在后藏传与觉敦梭曩喇嘛和雅陇玛惹赛薄两人。玛惹传宁巴赛绒，宁传则敦、松敦，从此传下的名男系。由觉敦传劳准，以下多女众，名女系。这种修“觉”的教授，遍于全藏各宗派，到现在没有断绝。
（3）廓札派，“廓札”是地名。这一派的创始人福幢（1182—1261），起初从释迦室利学修菩提心法，又从金刚祥学旧派密法，后来在贡摩山静修，证得大印甚深义，又从宝铠论师受胜乐灌顶。在底斯山专修五年，现证如理如量智，如实见金刚身真理。后在仰垛建廓札寺，因此又称廓札巴。他遍学新旧各派所传一切法门，所以当时前后藏的大德，没有一个人不从他参学。他的学说不一定属于那一派。
（4）响巴迦举派，“响”是地名。这一派的创始人是琼波瑜伽师，曾七度赴印度学法，亲近大善知识一百五十人，以大金刚座、弥勒巴、鞠多瑜伽、罗睺罗鞠多、尼古空行母、乐成就空行母等六人为主。归藏后在响地建一百零八寺，弘法三十年，摄受弟子八万余人，寿一百五十岁。他的教授都从印度学来，因此别成一派。
（5）霞炉派，又名布敦派。创始人布敦宝成（1290—1364），原是中兴律学的嫡派；后来又遍学迦当、迦举、萨迦所传的因明、对法、中观和各部密法，成为一代教主。三十一岁时住持霞炉寺，兴建七十余种大曼陀罗仪轨，广弘四部密法教授，并且校订西藏所翻译的大藏经，编有《大藏目录》，著述三十多函流传于世。晚年建霞炉山谷茅蓬，住着一百六十位修行者，霞炉寺常住僧三千八百人，讲说修行极一时之盛。弟子有法祥、童福、宝胜等，从此流传的教授，名霞炉派。
这些派别中，希结、觉宇，时代稍久，两者的教授和修法，已经融入其他各派中，没有独立的系统可寻。廓札和布敦两派教授，都普遍摄入萨迦、迦举、格登等派中，尤其是宗喀巴大师，尽承两派遗轨。这两派现在也没有单独流传。
（6）宁玛派，这一派就是前弘期中莲花生、无垢友、遍照护等所传的密法教授。在前弘期和灭法的期间，由娘智童、梭薄吉祥智、努佛智、功德海等继续传承，未曾断绝。到后弘期由功德海传仰慧胜，仰慧胜传仰智生，仰智生传素薄伽释迦生，再传素穹慧称。素穹的儿子卓朴巴释迦狮子广弘宁玛派各种教授于全藏。元朝末年有陇勤饶绛巴广学显密一切教法，后来传宁玛派宁提教授，并且造“胜乘藏”等七大藏论，广弘宁玛派。明末清初，有吉祥力胜在前藏建金刚崖寺，又有得达陵巴不变金刚建邬仅民卓陵寺，五世达赖也在尊胜利乐善说洲寺兴建宁玛派修法。是为宁玛派极盛时代。这些寺院后来虽然经准噶尔王一度摧毁，但不久就修复起来，世世代代有大德住持，至今未衰。西康的迦陀寺、佐勤寺等处，也世世代代有大德住持弘传，因此宁玛派教授也遍弘于全藏。
西藏因萨迦、迦举两派互争权势，真学实行的人日渐减少，到元末明初，显密教法都很衰微。除少数大德以外，几乎不知戒律为何事。虽然还有研究教理的人，仅仅能启发知识，而没有实义可修。尤其对于因明，误认为一种辩论方式，全不了解其中有证解脱与成佛的道果。对于密法，只知道乱受灌顶，偏修一部分教授，至于如何亲近师长，如何守护律仪和三昧耶等，全不讲求。此时具有卓绝见解整理弘扬佛教的，就是宗喀巴大师（1357—1419）。
宗喀巴，元至正十七年（1357）生于青海宗喀地区（即现在塔尔寺），十六岁进藏，先在极乐寺依吉祥狮子学《现观庄严论》。后来到后藏从宝胜大师、末底班禅等受学深法。后来到觉摩曩寺，从尊胜大师学六加行法（时轮法）。以后回那塘，从庆喜祥大师复习《现观庄严论》，从惹达瓦童慧大师学习《中观》、《现观庄严》等。后来回前藏，在觉摩陇寺从慧明律师学戒律，从措勤寺住持戒宝律师受比丘戒，从布敦大师高足法胜（或译法祥）大师受学《时轮金刚大疏》，从童福大师学布敦所传一切密法。后来遇到喇嘛中观师请问中观正见，闭关专修，获得中观甚深空见。又从住持迦当派教授的法依贤和虚空幢两位大师，受学阿底峡尊者传来的菩提道次第教授。
自修见行圆满之后，就作化他事。为整治当时戒行废弛的流弊，首先提倡戒律，自己和徒众著割截衣，擎钵持杖，少欲知足，清净自活。又鉴于大乘愿行根本，在于发菩提心和持菩萨戒，因此广弘修菩提心教授，并著《菩萨戒品释》，率领徒众切实履行菩萨学处。又因修行密法必须如法依止善知识，严守三昧耶戒，方有成就，因此广释《事师五十颂论》和《密宗戒》，为学密法的徒众，讲授修学。又为抉择始从凡夫直至圣果的修行次第，著《菩提道次第广论》和《密宗道次第广论》。五十三岁时（1409），在拉萨大招寺兴建广大供养法会，此后每年举行，流传至今。又在这年建立嘎登寺。大师六十三岁在嘎登寺示寂，大弟子嘉曹盛宝继位十三年，以后由克主杰善祥继位八年，流传到现在，每代都有大德继承法席。
大师的上首弟子妙音法王依照大师的嘱咐，在1415年建立哲蚌寺，第二年落成；大慈法王在1418年建立色拉寺，也在第二年落成；和嘎登寺通称为拉萨三大寺，是大师在世时所建黄教根本道场。后来根敦主巴，在1447年建立后藏札什伦布寺，广弘大师教法。又有阿里的慧贤，于芒宇建达摩寺，他的侄子又建立敕色寺，大师的教法因之弘布于西藏极西。又昌都的慧贤，在昌都建慈氏洲寺，更有许多大德，分别在西康南北各处建寺弘法，不胜枚举。
安东（即甘青等处）方面，起初有义成宝大师在妙翅鸟崖建寺，后来在宗大师降生处建立塔尔寺。第四世达赖时，又派人建滚陇寺，讲弘教法。妙音笑金刚在甘肃夏河地方建�