佛则唯以无缘大慈，同体大悲，渡脱众生为怀，了无人我彼此之心，纵度尽一切众生，亦不见能度所度之相，故得福慧具足。为世间尊，众生则唯以自私自利为事，虽父母兄弟之亲，尚不能无彼此之相，况旁人世人乎哉！故其所感业报，或生贫穷下贱或堕三途恶道，即令戒善禅定自修得生人天乐处，但以无大悲心，不能直契菩提。以致福报一尽，仍复堕落，可不哀哉。
是则唯欲利人者，正成就其自利，而唯欲自利者，乃适所以自害也，药师如来本愿经者，乃我释迦世尊，愍念此界一切罪苦众生，为说药师如来因中果上，利生之事实，为究竟离苦得乐之无上妙法也。
众生果能发慈悲喜舍之大菩提心，受持此经此咒及此佛名号，推其功效，尚可以豁破无明，圆成佛道，况其余种种果位，种种福乐乎哉，然在佛心固欲以无上觉道，全体授与一切众生，而众生智有浅深，固不得不随其所乐，令彼所求各各如愿也。
须知药师一经及与佛号，并其神咒，即释迦药师所得之阿耨多罗三藐三菩提法，凡至诚受持者，即是以佛庄严而自庄严也。
故玉琳琇国师常持此经，及此佛号，以是禅教律净之总持法门。故受持者或生净琉璃世界或生极乐世界，待至豁破凡情，圆成圣智，则直契寂光，东西俱泯，而复东西历然。随愿往生，则与弥陀、药师同归秘藏，是名诸佛甚深行处。
圣聪大师，以心安和尚所书之本，刻板流通，欲令受持者发起正信。祈简明以告之，又此经系唐玄奘法师所译，其八菩萨但举其目，未标其名，说咒一段，又复缺略。后之知识，欲令经义完全，故依七佛本愿经，添入说咒一段，共四百二十八字。依灌顶第十二经，添入八菩萨名，以三经原是一经故也。须知在昔，贝叶唯属抄写，或有遗亡以致译文全缺互异，后人添入深契佛心，故诸注者咸皆宗之，恐以藏本对校，致生疑虑，故略书缘起，以庆完璧云。
民国十一年壬戍冬月，古莘常惭愧僧释印光谨撰
【药师经跋】
－－－－－－玉琳国师
予辞恩绝尘，不暇披览，偶入藏阅药师如来本愿功德，不觉手额失声，愿人人入如来愿海也。或问何于此经惊叹如是？告之曰：予见世人顺境沦溺者不一。富贵可畏，甚于贫贱，今此如来，使人所求如愿，遂从此永不退道，直至菩提，则欲于王臣长者，一切人中作同事摄。不乘如来愿航，何从济乎？大凡修持，须量己量法，直心直行。诚能厌恶三界，坚志往生，则专依阿弥陀经，收摄六根，净念相继，所谓执持名号，一心不乱，决定往生。此先自利，而后利人者之所为也。若于现前富贵功名未能忘情，男女饮食之欲，未知深厌，则于往生法门，未易深信。即信矣，身修净土而心恋娑婆，果何益乎。则求其不离欲钩，而成佛智，处于顺境，不致沦胥者，固无如修持药师愿海者之殊胜难思也。若能信行，久久不懈，知不独富贵功名，转女成男，离危迪吉，如如意珠，遂愿成就。即得于一切成就处，直至菩提。永无退转，何幸如之。人间亦有扬州鹤，但泛如来功德船。
【两大法门】
竺摩法师
药师与弥陀两大法门，在释迦佛法中应该平衡发展才对，可是大家多知道有弥陀法门，求生净土，很少人知道有药师法门，能够延寿长生，这是什么原因呢？大概是中国佛法在晚唐的时候，经过三武一宗的毁法，天台贤首性相各宗经论皆被摧毁，唯禅宗不立文字，不用经典，山林水边，皆可做其功夫，故唯禅宗流盛，其他显教各种法门，皆告衰微。到了宋朝，宗匠不多，禅宗亦渐走下坡，而念佛法门，有起而代之之势。一句弥陀，天下披靡，所以净土法门独盛，人皆偏于念佛往生，送死度亡；致使消灾增福，现生可以随愿所求的药师法门，反而隐晦不扬，好似全部佛法，就只有净土法门全权代表，其他法门都一落千丈了！
到了清朝，有位玉琳国师出现，他阅大藏经，发见《药师经》，觉到药师佛所发的十二大愿，多是注重福利现世众生，繁荣现实社会。他觉得这个法门很合时代潮流，对偏重弥陀法门来讲，是有补偏救弊的作用，他就出来提倡，且替《药师经》流通本做了一篇很好的序文，里面有两句动人的诗句说：‘人间亦有扬州鹤，但泛如来功德船’。他对于这部经可谓推重备至。
在他两句诗中，还有一点意义要说明：从前有四个友人闲谈自己的爱好；一个爱有钱十万，享受富贵生活；一个爱去扬州玩耍，觉得扬州是人间天堂；一个爱骑鹤上天云游四海；另一个则很坦白，亦很漂亮，他要爱钱、爱去扬州、亦爱骑鹤去扬州。正所谓‘腰缠十万贯，骑鹤上扬州’，样样都要得到如愿以偿。现在玉琳国师的诗意，就在你们只要誧《药师经》，照《药师经》修行，游泛药师如来的功德法船，人间什么富贵都可以求得，“腰缠十万贯，骑鹤上扬州”，更无问题了。
又玉琳国师对于弘扬这《药师经》的因缘，还有好多好多。相传玉琳前世为僧，相貌奇丑。有相府千金之女布施财物，来寺分派众僧，分至此丑僧之前，心惊憎厌，不分给他。僧有感触，专礼药师佛，愿求来世相貌美丽，不使人家讨厌。结果转世为玉琳，相貌美丽、英俊非凡；而那位相府千金，因斋僧布施，转世仍为千金小姐，追求玉琳，费尽心机，不得所愿，生起相思病来，奄奄一息，几乎呜呼，未曾哀哉。后因相府邀请，玉琳收她为徒，教她打佛七，不敷脂粉，一心用功，睡不足，食不够，不断地坐香和跑香，七天之后，她的样子不是夜叉，亦成丑鬼。玉琳叫她对镜看看，你的美丽在那里？小姐见到镜中丑样，顿悟人生如幻，一切无常。后来亦发心学佛，不贪人间富贵，骑鹤上天，而是归心净土，神游净域了。
【并行不悖】
竺摩法师
这两法，是指药师法门与净土法门。药师法门是重于现生的消灾延寿的，释尊把这延生法门，付之于药师如来；净土法门是重于将来度亡往生的，释尊把这法门付之于西方的弥陀如来。这两大法门是佛法大宗，如果弘法的法师不分东西，同时弘扬，并驾齐驱，则学佛之人，延生度亡，各有所托，如车之两轮，鸟之两翼，缺一不成，这是最好不过的。古人说：“道不同不相为谋”；今既同为佛为道，自然可以并行不悖，同时并进，兴旺佛法，也是众生的幸福！
在释尊未说《药师经》之前，先说《阿弥陀经》，把西方佛国净土的依正庄严已说得很详细清楚，所以在东方净土的《药师经》中，只于学理多点述说，净土依正庄严的事相略为提到吧了。同时这二种法门，在《药师经》中已见有说法融会不可拘泥的地方。如经中所说：
“曼殊室利，若有四众苾刍、苾刍尼，邬波索迦、邬波斯加，及余净信善男子善女子等，有能受持八分斋戒，或经一年，或复三月，受持学处，以此善根，愿生西方极乐世界无量寿佛所，听闻正法而未定者，若闻药师琉璃光如来名号，临命终时，有八大菩萨，其名曰：文殊师利菩萨、观世音菩萨、得大势菩萨、无尽意菩萨、宝檀华菩萨、药王菩萨、药上菩萨、弥勒菩萨，是八大菩萨，乘空而来，示其道路，即于彼界种种杂色众宝花中，自然化生，或有因此生于天上，虽生天上，而本善根亦未穷尽，不复更生诸余恶趣。天上寿尽，还生人间，或为轮王，统摄四州，威德自在，安立无量百千有情于十善道。’
从这段经文中，很清楚地告诉我们：如果有念阿弥陀佛的男子女人，持戒修斋，愿生西方，亲近弥陀，或因功力不足，其心未定，到了临命终时，若能有福分听到药师佛名，或意念药师佛名号，临终就有八大菩萨，亲来迎接，引导你于西方众色莲花之中，自然化生。或因你积善的福分而生天上，不生恶趣；天上寿终再生人间，亦为圣王，教化人民，同行十善法门，使国家和乐，人民安居。由此足证念佛之人要生西方的，亦不必认为念东方药师佛就不对，或以为念错了，那完全是自己对佛法思想未曾搞通的错误。现在既说闻药师佛名，临终就有八大菩萨来导你往生西方，反过来说，你若念药师佛名，将来要求东方药师佛的琉璃净土，或因功力不足，心意未定，若闻阿弥陀佛名号，可能亦来这八大菩萨送你生于东方琉璃世界。本来佛佛道同，十方净土在圣者境地，应无分别隔离，众生我见未忘，妄想分别，多生执障，反而画地自限，弄得自己隔离不融了。六祖惠能曾说：“东方人念佛要生西方，西方人念佛又生什么地方呢？”我们现在可凭上段《药师经》意，大胆地答复六祖：“西方人念佛，亦可以生东方净土。”六祖重禅，意在破除念佛人之执障，那么我这样说法，如能会融佛意，想不致于离题太远，有什么大过错的吧！
在《药师经》中还有一个特别的说法，在其他经中并不多见。他说我们人生下来就有两个“俱生神”，与生俱来，跟着我们，记载我们一生所作的善恶，一神记善，一神记恶，“随其所作，若罪若福，皆具书之”，历历分明，一丝不紊，到各人临终之时，此二神负责将此纪录罪福之书，“尽持授与阎魔法王”，由王凭此纪录，推算罪福，而判定之。有福者上升，自无问题，造罪者将沦苦处，忧怖万状，那时若有在生亲戚家眷为他诵经礼忏，忏悔修福，亦可减轻他们业报，所以这《药师径》虽然注重延生求福延寿，同时亦注意到亡者的利益，可谓“冥阳两利，存殁均沾”之宝典。吾人学佛目的为“净佛国土，成就众生”，那就不可不注意修习了！
【药师经轨】
何子培
《药师经》翻译最早者，为《佛说灌顶拔除过罪生死经》，即《大灌顶神咒经》卷十二，东晋帛尸梨密译。次为《琉璃光经》一卷，刘宋慧简译。三为《佛说药师如来本愿经》一卷，隋达磨笈多译。四为《药师琉璃光如来本愿功德经》一卷，唐玄奘译。五《药师琉璃光七佛本愿功德经》二卷，唐义净译。以上称为《药师经》五译。此中前四译，单述药师如来之事，故云《药师经》。第五译于上卷述六佛之事，下卷述药师如来之事，故云《七佛药师经》。然普通所谓《药师经》者，系指玄奘译本而言。
其疏释有《药师经疏》一卷，唐窥基撰。《药师经钞》二卷，善珠撰。《药师经疏钞》，伯亭老人着。《药师经疏钞择要》三卷，普霦据伯亭老人疏钞而节要者。《药师经灯》一卷，净挺着。《药师经直解》二卷，清天台灵耀撰。《药师经古迹记》，唐新罗国太贤撰（新罗国即今朝鲜）。《药师经纂解》四卷，亮汰述。皆玄奘译本也。
此外尚有《药师如来观行仪轨法》一卷，唐金刚智译。《药师如来念诵仪轨》一卷，唐广智不空译。《药师琉璃光如来念诵仪轨》一卷，唐一行撰集。《药师七佛本愿功德经念诵仪轨》，《药师七佛念诵仪轨供养法》，均元沙啰吧译。
又忏法有《药师忏》一种。关于药师如来经轨，大约在是矣！
【药师王佛】
药师佛，又作药师如来、药师琉璃光如来、大医王佛、医王善逝、十二