由于止随逐三观，内心相续，一直没有间断。按常理，止观的次第是先修止后修观，观是由依止而生的，既有能依的三观，就有了随有相观的有相止、随寻求观的寻求止、随伺察观的伺察止；色界的四静虑与无色界的四无色定（空无边处定、识无边处定、无所有处定、非想非非想处定），各有一止，共成八止；慈、悲、喜、舍的四无量心中，各有一止，共有四止。因此我们知道大乘瑜伽止观中止的种类差别，有三类十五止。
2、观的种类差别
上面明确的说明了止有三类十五种，那么观呢？对于观的种类差别，佛在〈分别瑜伽品〉中说：
毘钵舍那略有三种：一者有相毘钵舍那；二者寻求毘钵舍那；三者伺察毘钵舍那。29
在这里，我们知道观种类差别三种，在此略作说明：（1）、有相观：相是有分别影像境，就是纯粹的、唯一的以四种所缘境事中的有分别影像为所缘境。有相观是从似法似义的境上立名的；（2）、寻求观：以闻思修的三慧，遍于彼法彼义没有善解了的一切法中，为善解彼法，了达彼义，再进一步的对彼作意观察，谛审思维，故名寻求观；（3）、伺察观：以修所成慧，遍于彼义已善解了的一切法中，为求于彼善巧证得极解脱的关系，更进一步的对彼作意观察，谛审思维，由于作意思惟的能力，解决障蔽，而得解脱。
（五）、瑜伽止观的依法总别
众生的根性有利有钝，佛陀慈悲，利钝全被。学人在修习大乘瑜伽止观法门的时候，就有了依法、不依法差别。这两种根性在佛经中通常分为“随法行”和“随信行”。佛陀在经中就大乘瑜伽止观的依不依法说：
若诸菩萨随先所受所思法相，而于其义得奢摩他、毘钵舍那，名依法奢摩他，毘钵舍那；若诸菩萨不待所受所思法相，但依于他教诫教授，而于其义得奢摩他毘钵舍那。谓观青瘀及脓烂等，或一切行皆是无常，或诸行苦，或一切法皆无有我，或复涅盘毕竟寂静，如是等类奢摩他、毘钵舍那，名不依法奢摩，他毘钵舍那。30
学人在修习大乘瑜伽止观时，依其前面所修的闻慧所受、思慧所思的五法相，且于法相所诠的义理修习而得止观，是为依法止观，这也是随法行的利根众生；不能假籍闻慧所受、思慧所思的五法相修习，而要依靠别人的教导去行，如观青瘀及脓烂等外相，才能了知无常、苦、空、无我等法，方得止观，是为不依法止观，这也是随信行的钝根众生所行。
下面谈谈大乘瑜伽止观的缘法总别。在经中佛陀告诉大家：
善男子！若诸菩萨缘于各别契经等法，于如所受、所思惟法，修奢摩他、毘钵舍那，是名缘别法奢摩他毘钵舍那；若诸菩萨即缘一切契经等法，集为一团、一积、一分、一聚作意思惟：此一切法随顺真如，趣向真如，临入真如，随顺菩提，随顺涅槃，随顺转依及趣向彼，若临入彼。此一切法，宣说无量无数善法。如是思惟修奢摩他、毘钵舍那，是名缘总法奢摩、他毘钵舍那。31
缘别法就是对佛陀所说的十二分教中，一一获得正确的认识，由于各别了知诸法的法相，于是如所受持、如所思维的修习止观；总法是将佛陀的一切经典教义，总集起来加以作意思维，审虑观察。
大乘瑜伽止观的缘法总别还有大、小、无量的区别，对此佛陀在〈分别瑜伽品〉中告诉弥勒菩萨：
善男子！若缘各别契经、乃至各别论义，为一团等作意思惟，当知是名缘小总法奢摩他、毘钵舍那；若缘乃至所受所思契经等法，为一团等作意思惟，非缘各别，当知是名缘大总法奢摩他、毘钵舍那；若缘无量如来法教，无量法句文字，无量后后慧所照了，为一团等作意思惟，非缘乃至所受所思，当知是名缘无量总法奢摩他、毘钵舍那。32
以闻慧的所缘境（十二分教），实践止观行，因所缘的对象，有所局限，范围不大，因此为“小”；以思慧缘所缘法，实践止观行，它是将十二分教总摄思维，所缘的对象范围很广，因此为“大”；以修慧的所缘境，实践止观行，修慧的所缘境，依于闻思的境界而缘。它离于闻思的境界而缘，范围更加广泛普遍，不为闻思所限，“无量”宽广。
（六）、瑜伽止观的位次诸相
1、总法止观的五因五果
瑜伽止观行者需要具备集总修、无相修、无功用修、炽盛修、无喜足修的五个条件，才能获得总法止观。也可以说，以上面的五修为因，才能得到下面的五种殊胜妙果：
善男子！由五缘故，当知名得：一者于思惟时，剎那剎那，融销一切粗重所依；二者离种种想，得乐法乐；三者解了十方无差别相无量法光；四者所作成满相应净分无分别相，恒现在前；五者为令法身得成满故，摄受后后转胜妙因。33
就五因五果的因果关系：真谛三藏34是次第配合的，修一因得一果；《大乘庄严经论》35里面认为：五果中的前二果是修“止”所成，后面二果是修“观”所成，最后一果是止观俱修而成。实际上，地上的菩萨，每地都是定慧圆修的，五果都是止观俱成；只是《大乘庄严经论》的侧重点不同罢了。
2、总法止观的所得通达
在怎么样的位次，才能正式的通达、得到总法止观呢？从菩萨十地中，最初的极喜地到佛果，每地都是通达总法止观；从第三发光地到佛果，都可得到总法止观；地前初发心人菩萨，能够在总法止观随顺修学，作意思维，也是难能可贵的36。
3、总法止观在寻伺等三摩地
寻伺是心所法中属于不定的两个心所，依它的体说，并以思慧的一分为自体；依它的用说俱以安不安住身心分位的所依为它的业用；假使他们对“意言境”予以深度的、细致的伺察，是伺的相貌，不加深刻的分别，只是粗显的寻求，是寻的相貌37。总法止观在寻伺等三摩地中地位，如经所说：
于如所取寻伺法相，若有粗显领受观察，诸奢摩他、毘钵舍那，是名有寻有伺三摩地；若于彼相，虽无粗显领受观察，而有微细彼光明念，领受观察诸奢摩他、毘钵舍那，是名无寻唯伺三摩地；若即于彼一切法相都无作意。领受观察诸奢摩他毘钵舍那。是名无寻无伺三摩地。……若有寻求奢摩他、毘钵舍那，是名有寻有伺三摩地；若有伺察奢摩他、毘钵舍那，是名无寻唯伺三摩地；若缘总法奢摩他、毘钵舍那，是名无寻无伺三摩地。38
为什么在这里用寻伺等三地分别止观呢？这三地如以三界九地分别：欲界的五趣杂居地及色界初禅的离生喜乐地，不论是定还是生，都名有寻有伺三摩地；欲界及初禅的静虑中间，初禅与二禅的静虑中间，不论是定还是生，都名无寻唯伺三摩地；从二禅的定生喜乐地乃至到非想非非想处地的几地，都名无寻无伺三摩地。
4、瑜伽止观的三相
（1）、止观的止相：如果内心产生掉举与昏沉，或者还没有生起的时候，以无常、苦、不净等可厌法来作意思维，使它们得以息灭消除，并且心念相续，是为“止”相39。
（2）、止观的举相：若果内心沈没，或者是在内心还没有沈没的时候，在观佛的相好、三宝的功德、菩提心的胜利等可欣法作意思维，并且心念相续作意，是为“举”相40。
（3）、止观的舍相：若果做到上面的几个方面，完成于一向以来专修的止观二道，或者止观二道同时和合俱转。如果在修二止观时，已将二随烦恼解决了，其心已能平等运转的话，就不在加功用行了，是为无功用作意及心任运转中所有作意，是为“舍”相41。
（七）、瑜伽止观所摄定及因果作业
1、瑜伽止观所摄定
学人在修习止观的三摩地—定，是很多的，大乘瑜伽止观法门中，不论是声闻、菩萨、如来所修的无量定，没有一个不是它所摄的。佛在〈分别瑜伽品〉中说到：
佛告慈氏菩萨曰：善男子！如我所说无量声闻、菩萨、如来，有无量种胜三摩地，当知一切皆此所摄。42
2、瑜伽止观的因果
以什么样的因才能修大乘瑜伽止观法门呢？佛陀在〈分别瑜伽品〉中说：
此奢摩他、毘钵舍那以何为因？善男子！清净尸罗，清净闻、思所成正见，以为其因。此奢摩他毘钵舍那以何为果？善男子！善清净戒、清净心、善清净慧以为其果。43
大乘瑜伽止观法门，以严持清净的戒行，清净的闻、思所成的正见为因来修，由戒才能生定，有正见才能有正确的思维，如此才能成就所愿；由前因获得善清净戒、善清净心、善清净慧的如实果报。除了这正所得的果之外，一切声闻及如来等所有世间及出世间一切善法，都是止观所得果。
3、瑜伽止观的业用
能知的心识去认识所知的诸有漏法时，本应了解它的如幻如化非有似有的，但因有漏的相分力，使能见的见分失去这种力用，而且由无明蒙蔽的因缘，不特不能了知有漏的色心等法，是如幻非有，反而妄执它有实在的自体；前六识对各自所缘的相分，本可了知它的如幻非有的，但因第七末那识恒长时间的有我痴、我见、我爱、我慢与它相应的关系，所以就影响到前六识的认识不清，妄执自所缘的境相有实在的自性，因此就产生了“相缚”及“粗重缚。
瑜伽止观的殊胜业用在于能够解脱心识方面所生起的相缚及粗重缚。佛陀在〈分别瑜伽品〉中说：
世尊！此奢摩他、毘钵舍那能作何业？善男子！此能解脱二缚为业，所谓相缚及粗重缚。44
相缚和粗重缚能够使众生系缚在生死大海里不能出离，如要挣脱这两根强有力的绳索的系缚，唯有勤修无漏、出世的解脱道。而大乘瑜伽止观法门无漏清净，所以只要正确的去修就能解脱二缚。
（八）、瑜伽止观能证菩提的过程
行者修习瑜伽止观的目的是为了求得无上正等正觉。所以，在不断的实践中，完成止观行，依此止观正道精勤于行，证的无上正觉。因此，经中说：
善男子，若诸菩萨已得奢摩他、毘钵舍那，依七真如，于如所闻所思法中，由胜定心，于善审定，于善思量，于善安立真如性中，内正思惟……以楔出楔方便，遣内相故，一切随顺杂染分相皆悉除遣。相除遣故，粗重亦遣。永害一切相粗重故，渐次于彼后后地中，如炼金法陶炼其心。乃至证得阿耨多罗三藐三菩提，又得所作成满所缘。45
修学瑜伽止观的行者已得止观后，依止七种真如（流转、相、了别、安立、邪行、清净、正行真如），对于过去所听闻、所思维的法中，由殊胜的止观的定心，使闻、思、修安立在真如性中，内正思惟。依七种真如的正思惟，在能观的心上，一切所执受等的细相现行，皆能弃舍，那散心位上的一切粗相，或一切染污所现的粗相，以及欲界下地所现的一切粗相，也就弃舍了。对于细相，经中谓：
言细相者：谓心所执受相，或领纳相，或了别相，或杂染清净相，或内相，或外相，或内外相，或谓我当修行一切利有情相，或正智相，或真如相，或苦、集、灭、道相，或有为相，或无为相，或有常相，或无常相，或苦有变异性相，或苦无变异性相，