的战斗，一场破获“死亡之神”和 “地狱行动” 的精彩战斗打响并层层翻滚推向高潮。最终，真正的黑衣大神现身了，她就是匪首小桃和薇儿。小桃得意地告诉狄公所谓“地狱行动”的全部设想，也告诉了他“死亡之神”和“地狱行动”的全部真相。这听起来真有些令人毛骨悚然，也颇有些大难临头的味道。然而，狄公却自信地笑了，并娓娓动听地讲了一个黑衣大神的“真正的故事”，这故事把匪首们都听傻了。
狄公从黑衣社的起源开讲，一直讲到她们此行的全部细节和态势，分析得丝丝入扣毫厘不爽。就在这时，外面响起惊天动地的喊杀声。狄公告诉匪首们，这是凉州卫大将军风扬率领各军卫铁骑进城擒杀黑衣社叛党的声音。匪首们顿时惊呆了。接着，狄公开始讲述他层层分析破解这一切的神奇经历，当最后讲到匪首小桃和薇儿以为黑衣社已经得手的种种情态，只是他用以迷惑黑衣社的骗局时，小桃绝望地昏倒过去。然而，薇儿扶住了她，因为狄公的故事还没有讲完。狄公终于讲到了最后的决战，讲到了双方力量的部署和战役胜败的变化，可谓有声有色，动魄惊心。当小桃和薇儿自知失败在即的时候，小桃拔剑抵住狄公企图做垂死挣扎。她的逼迫被李元芳轻易化解了。这时张环、李朗率队将院子团团围定，黑衣大神小桃和匪首薇儿束手成擒。狄公说生命可贵，只有尊重别人的生命，自己才有生存权。神是仁慈不嗜杀生命的，黑衣大神应该明白这一点。小桃说这个世界没有公平和仁慈可言，是非功过只有胜利者才有资格评判。狄公说所以你永远不会成为胜利者。
在小桃的最后请求下，她与薇儿和另外两个大户法自裁了。她们临死还抱着来世不渝的夺取甘凉的念头。狄公无奈地摇了摇头。曾泰问狄公为什么翠红院的暗道直通归义伯府而不通暗道网，狄公一语惊人，道出了一段鲜为人知的黑衣社祖先情感隐秘，那是一段饶有意味的故事……
凉州城终于恢复了她往日的繁华。只有被贴了封条的翠红院，狼藉荒荒，空空荡荡。镜头缓缓升起到房梁之上，梁柱之间，一只红蝙蝠静静地卧着。
《神探狄仁杰3》之《邗沟案》
第二个故事《邗沟案》
雷鸣电闪，大雨如注。大运河长江通往淮水的邗沟水面波涛汹涌，白浪浊天。狂风暴雨之中，江淮盐铁转运使官船不幸在邗沟覆没。但这不是一桩偶然的事件。因为，这样的覆船事件在这一特殊的水段一年之内已经连续发生十五次了。结果是数百万石食盐损折，船毁人亡！而朝廷派去扬州查察此事的工部官员一批又一批，均是无功而返，可邗沟覆船的异事却是一次紧似一次。更有甚者，此番出漕调查的水部郎中李翰竟然在任上自缢身死。由于盐运受阻，西北各地军民所用食盐已呈紧张之势。而今，邗沟渠道已成死地，北运停止，盐荒已经发生了！武则天急召自凉州回京复命的狄仁杰进宫，改任他为江南道黜置大使，兼江淮都转运使，奉旨钦差，整饬吏制，察查邗沟覆船大案。狄公带领李元芳、曾泰赶赴扬州，经过艰苦卓绝的调查和推断，终于使全部案情真相大白。所谓的邗沟覆船案，乃是江湖巨恶铁手团纠集官府及绿林各道联手策划的巨大阴谋，首先铁手团派出杀手在邗沟将江淮转运使运盐船队凿翻；而后，出动水鬼将沉入水中的官盐盗捞起存。紧接着派出大趸船将盐转运出境，而漕运使杨九成，则是为私盐转运提供一切便利，开据官凭路引，逃避巡河官的检查。之后，扬州刺史崔亮、长史吴文登便粉墨登场，利用职权威逼利诱淮北各地方官吏，遏止官盐入淮，人为地造成淮北盐荒。这样他们便独霸淮北盐市，明目张胆地将邗沟落水的官盐以高价发售到盐荒各县，以牟取暴利。好一张官匪合谋的大网啊，真是令人触目惊心！
盱眙的盐荒解决了，狄公命令自即日起，何家盐号关闭，全城百姓可到城里的另三家盐号买盐，盐价二十文一斗！官府的平盐令一发，立时举城震动，百姓们从四面八方赶到三家盐号购盐，那情景真是热烈，堪称造福一方，解民倒悬。不知谁在街道上放起了鞭炮，转眼之间，鞭炮之声响彻全城，死气沉沉的盱眙，终于复苏了。
狄公没有沉浸在一时的胜利之中，他乘胜组织举行卧虎庄会战，在洪泽湖宾馆遭遇了铁手团，扬州刺史崔亮、长史吴文登和漕运使杨九成也公开露了相。狄公认为来的不只是他们三个，果然，铁手团宗主大步走进门来，冷冷地望着狄公。他就是邗沟覆船的主谋也，也是鸿通柜坊之主——颖王元齐。最后的战斗动魄惊心，武功盖世的元齐被李元芳杀死，铁手团属下除被杀者外，全部投降。隐藏最深的铁手团卧底林阳也落入法网，他就是一直跟随在狄公身旁的山阳县令鲁吉英。葛天霸虽身犯重罪，但关键时刻协助大军攻破卧虎庄，又主动将邗沟覆船失踪的官盐献出，并装上趸船，足见投诚之意。狄公依前言，特免其死罪，准居盱眙城中。
灾难深重的邗沟终于通航了！沉寂了两年的大运河，又喧嚣起来了。淮北终于可以吃到朝庭的官盐了。狄公望着宽阔的河面，心情久久不能平静。破案捷报传到洛阳，武则天读罢奏折缓缓起身，目光扫过下站群臣道：邗沟覆船已发两年有余，各部遣吏皆不能破，独狄怀英精缜谋查、俯仰事非，旬月便告功成，真是神乎其能啊。狄怀英折中所奏，一概照准。这时忽有内史姚崇快步出班奏道：日前接剑南道快报，益州地陷，露出上百具无头尸身。此事蹊跷诡异，地方官吏无从排查，因塘报阁部，请陛下定夺！武则天沉吟片刻道：立即传旨，召怀英、李元芳、曾泰回朝！
分集剧情：
第一个故事：《黑衣社》
第01集
唐武周年间，边事频仍，连年征战。大周朝国帑虚竭，守边将士军心不宁。
这一天，忽有钦天监来报说，飞鸟触柱、池鱼殃死、天现异兆。根据天象台地动仪的显现，将有大地震在西北发生，并波及神都洛阳。武则天当即吩咐快马通知有关道、州做好抗震抗灾的准备。她特别想到押运巨额帑银赴边的铁甲军，吩咐派出600里加急快马，务必通知他们小心防范。
此时的狄仁杰正带领着李元芳和四大军头，蜿蜒在去往凉州的山道中。
当一行人无意中投宿某座蹊跷的小庙时，奇怪的事情发生了。
事发突然，光怪陆离。一通打斗之后，他们救下了一个身受重伤的小女子。可惜小女子说了几个奇怪的字眼，并托付一条花纹古怪的腰带后，很快就死去了。
朝廷的加急快马没有追上铁甲军。大将军房哲带队押运着巨额饷银开进了大漠。
第02集
不幸事情终于发生了。沙漠像上帝筛糠一样颤抖起来，黄色的沙暴以排山倒海之势扑向铁甲军。数十米高的沙墙呼啸奔腾，以摧枯拉朽之势，将铁甲军车驾人马席卷抛洒腾空四散。凉州刺史曾泰是狄公的门生，他接到朝廷急报，立即派出队伍进入大漠去寻找接应铁甲军。但是，当援军找到这支队伍时，发现军中所有人都中了邪，而他们押运的饷银，就仿佛被沙暴席卷的沙丘一样，不翼而飞无踪可寻了。这惊天的变故令曾泰瞠目结舌战栗不已。
夜里，狄公一行无意中来到一处南北朝时代的古堡。狄公觉得在这荒无人迹的深山中，这古堡建得十分蹊跷，古堡主人解释云云。狄公蓦然想起小庙中供奉的那尊塑像，联想起小庙的那个夜晚，他隐隐感到这个古堡主人，这座古堡与小庙和那个奇怪的塑像，似乎有着千丝万缕的联系。
第03集
狄公想到小庙那个神秘死去的小女子，一连串的疑问涌入心中。第一，究竟是什么人，为什么要不顾一切地追杀这样一个柔弱的女子呢？而小庙中的机关埋伏又是怎么一回事呢？还有那位神秘而恐怖的塑像，与这一切又是什么关系呢？这里面一定大有文章。联系到小女子死前所说的话，还有她留下的腰带，狄公作了一个大胆的推断。
这时，蹊跷的事情又发生了。古堡女主人请去李元芳，托他捎一封书信，地点和小女子死前交待的一样。她还嘱咐此事切不可让任何人知道，包括她的夫君。这仅仅是一种巧合么？狄公隐隐有了不祥的预感，经侦查，他们很快发现了转运使押送货物的大车，发现了大车旁数十名当地村民的尸体。是什么货物如此重要，令匪徒残杀如此众多的村民？！可以肯定，他们正在筹策一个巨大的阴谋。狄公一行的行动被发现了。一场生死搏斗势所难免。
第04集
经过一番激烈较量，李元芳大展神勇，杀得匪徒们鬼哭狼嚎，狼狈遁走。但是他们利用机关施放毒气，狄公等人命在旦夕。古堡夫人突然赶到出手施救，狄公等这才转危为安。
凉州刺史曾泰初步查清铁甲军下落，他们已全体中邪口喷鲜血而亡。案情发生，曾泰采取紧急措施。一方面封锁州境，盘查各商旅游众，没有签批不得擅离，发现可疑立即拘押；一方面驰报朝廷听后处置。这时，城中、军中、衙中传言四起。曾泰鉴于百姓的迷信心理，要求众官注意舆论，控制事态，以防激起民变。
狄公等在路上救起个身受重伤的骑兵军官，他们暂宿洪家堡村，又遇到女扮男装的姑娘小桃。从小桃口中，他们进一步了解到匪徒的情况。在狄公、李元芳的默许下，小桃联络村中群众，特别是苦大仇深的青年准备起义抗暴。但他们的行动被发现了。
第05集
狄公等预感到敌人马上会来报复，于是动员群众布置对策。果然，匪徒大批赶来，李元芳一马当先杀入敌阵，狄公带领群众随后掩上，一举挫败了匪徒的诡计。经审问俘虏，狄公了解到，他们的头目都是武林绝顶的高手。但具体是谁，他们不知道。匪徒社在凉州地面约有三十个设有同样机关的小庙，他们就是利用小庙机关，装神弄鬼诈骗百姓钱财。狄公感到匪徒在凉州根基之深、势力之大、影响之广已不容小视。
狂风呼啸乌云翻滚的黑暗之山，匪首们鉴于曾泰封锁州境，劫夺的饷银无法运出，遂决定设法在凉州城境内，分散与前来的天坨商人秘密交易，要创造机会，将“死亡之神”带出凉州找到安全的藏所，以备下一步“地狱行动”之用。这时的凉州城，已有百来个西域商队困留城中，众商队鼓噪喧嚷闹着出城，但曾泰扛住压力岿然不动。
狄公及时赶到了，听了曾泰关于铁甲军中邪和饷银失踪的报告，所有人都大吃一惊。
第06集
狄春三人来吉祥巷送信，竟遭遇了不测……
狄公批评了曾泰对匪徒的漠然不知，指点了上奏朝廷的奏章写法。果然，奏章抵达朝廷后，皇帝武则天按照狄公的意图，传旨停止了他的休假，任命他为内史并西北道黜陟大使，赴凉州调查饷银案。
提前大军前来凉州报告的两个斥侯，证明狄公带来的封条就是饷银封条，匪徒作案的推断被最终证实。狄公立刻传令进剿古堡，夺回饷银擒拿逆贼。
更不平静的是凉州城中的天坨商人们。他们焦急等待着出手奇货——死亡之神。匪徒终于出现了