舞着马刀冲进来，接着是步兵，他们毁灭所见到的一切，包括书籍、灯、古兰经和宗教的供奉物品，这一切都和拼死抵抗者一道被打翻在地，遭到践踏。正如阿拉曼所记述的，整晚和次日一整天，法国军队“像魔鬼一般在街上乱跑”，而怒气未消的拿破仑命令邦将军（他接替不幸的迪皮将军成了开罗城的卫戍司令）“将大清真寺夷为平地”。接着便开始了对暴动的清理工作和公共关系恢复工作。有罪的人被严厉处罚，但正如邦将军所说的那样，拿破仑“要显示他是个既恐怖又仁慈的人”。贝尔蒂埃指示迪盖，“我希望你能注意，将军公民，这个国家里的一些聚众闹事的头目应该为这次起义负责”，“我们对这些渣滓要毫不留情的镇压”以便“恢复开罗的秩序”。事实上，拿破仑有意放任他的军队采取报复行动，大肆屠杀平民，包括妇女和儿童——受到惊吓拼命逃跑的孕妇甚至将婴儿生在了大街上。到了下午4点，法军来到达艾兹拜基耶广场，随之而来的是一些驮着胀鼓鼓大麻袋的驴子。当麻袋打开时，血淋淋的阿拉伯人头滚到广场上。这只是刚刚开始而已。
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第十章蒂沃利花园和其他（2）
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当阿扎清真寺的大火还在熊熊燃烧时，拿破仑要用恐怖的手段惩戒敢于反抗的暴民。他命令贝尔蒂埃“将一切手持武器的囚犯予以斩首”，然后“将他们的尸体扔进河里去”。10月27日，拿破仑告诉雷尼尔将军“开罗已经完全恢复了平静……每天晚上我们都要砍掉30颗人头”，其中包括煽动这次起义的15名在开罗城非常具有影响的宗教领袖和国民委员会成员。
光靠残酷镇压是不够的，拿破仑增强了城堡的守军和加强构筑工事，大量储备弹药和粮食。他还新建了3座堡垒用来监视城里可能发生麻烦的地方，他用这次被杀害3个军官的名字卡明、迪皮和絮尔柯斯基为这3个堡垒命名（最后一个堡垒就建筑在一座大清真寺内，大炮就架在寺院的尖塔上，数百名守军的战马就养在寺院内）。如果说埃及人民开始的时候被拿破仑假意赢得穆斯林人心的手段所感动，现在他的野蛮和残忍使他们醒悟了过来。
这次暴乱引起的伤亡，根据拿破仑给督政府的报告称法军死亡57人，但给雷尼尔的信中却说只有8人。根据德托耶的统计，估计法国军队至少伤亡了250人。拿破仑从来不提供一个正确和修改的报告。至于说到埃及人的损失，拿破仑认为至少有2；500人，而根据贝尔蒂埃的统计埃及人的伤亡至少有4；000到5；000人。“我无法表达我所感到的恐怖，”布列纳写道，“但我必须承认这次的大屠杀至少在相当长的一段时间内保持了社会的平静。”
埃及各地的一些战斗十分激烈。英国舰队封锁引起的焦虑和由此造成的孤立无援是一个严酷的事实，10月21日至23日所发生的埃及人民起义使开罗增加了大量新的工事和堡垒，让人对这次流血事件记忆犹新。在这样的情况下，不，应该说特别是在这种不确定和充满压力的情况下，法国的士兵和军官更加需要放松和娱乐（至今为止拿破仑的个人活动也只是到金字塔去游玩了一天，他看着兴致勃勃的蒙日冒着酷热爬到了金字塔顶）。
虽然在开罗的欧洲人并不多，但一些大胆者很快就想到了要用咖啡馆、音乐会、法国式的洗浴、烟店，甚至剧院来填补这里的空虚。女人当然是不可缺少的，虽然大多数法国军官不喜欢阿拉伯女人，但他们也得为他们的士兵着想。1798年11月底，连通常脸色阴沉、不善社交的拿破仑也参加了蒂沃利花园的开幕式。
这件杰作的策划人是一个名叫达格瓦的法国人，他要将这个花园建成开罗“最大的、最美丽的”公园和娱乐场所。这片位于开罗广场附近、占地数公顷的芳草萋萋的绿洲“覆盖着橘树、柠檬树和其他果树”。在喷泉、石桌、石椅、音乐和女人中间可以发现一栋古老的官邸，在里面“可以找到各种形式的娱乐消遣，凡是人们能够想到的以及开罗能够提供的这里应有尽有”，不用说“还有有着大量杂志和书籍的阅览室”——总之，“所有可以给社会提供娱乐的东西，在这里都一应俱全”。只要每月缴30法郎，便可以使用这里的一切设施；但是，每天下午4点到晚上10点才开放——过了晚上10点为了保障安全，所有的军官都必须回到自己的岗位。
有一天夜里，邦将军的师团正在开罗广场附近游行，并成功地将一只热气球升上了250英尺高的天空。拿破仑本人带着他的副官贝尔蒂埃等人，身着戎装在蒂沃利花园露面了，仅有的几名欧洲女人很快就被他们邀请去跳舞或是在芬芳的果园里散步；而在官邸里，有更多女人陪同的赌博活动颇具吸引力，此外便是餐厅和咖啡馆。但对于半年来没有接触过女性社会的法国军人来说，那二十几个身着盛装的妙龄女子才是最富有吸引力的。焰火表演同样受到欢迎，包括两个打扮成小鬼身上发出火星的土耳其小丑的表演。
显然，正是在这些场合，拿破仑遇到了令人销魂的20岁的波利娜·富雷丝，22岁的中尉沙瑟尔的妻子。虽然拿破仑身边有几个年轻的阿拉伯女子，但他感到她们缺乏情感，他只和其中一名年轻女子有过一阵来往；直到遇见波利娜，此后一个星期他和她形影不离。由于对妻子约瑟芬不贞的愠怒，拿破仑决定将波利娜·富雷丝作为自己的情妇，让她在厄尔费宫附近的一栋小房子里住下。
“有丑闻传出，说一法国军官年轻美貌的妻子讨得了总司令的欢心。”沉着的德托耶在日记中写道，“丈夫已奉命回法国出差，这样的安排使大家各得其所。人人都在津津乐道地谈论他占有她的细节。据说这个少妇现在每天都乘坐将军的马车。”很快“整个军队”都知道了这件风流韵事，并称富雷丝是总司令的‘克里奥帕特拉①’。“这一外号很快就在司令部传开了，成了每个人津津乐道的话题。”布列纳讲述道。最后，这事反使得拿破仑不显得那么可怕了，对下级军官也有了笑容。布列纳还说拿破仑本希望波利娜·富雷丝为他生个孩子。“但我无能为力，”拿破仑说道，“这个傻女人不会生孩子。”这一讥讽后来传到富雷丝的耳朵里，她当着布列纳的面对拿破仑反唇相讥道：“天呐！那不是我的过错！”当波利娜·富雷丝的丈夫又突然出现在埃及（在海上被英国人俘获又放回）时，拿破仑很生气。富雷丝很快和她的丈夫离了婚，拿破仑又非常高兴——但这桩离婚案后来在法国受到了质询。
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第十章蒂沃利花园和其他（3）
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然而，除此之外，东方远征军的每一个人都感到这场战争是无法忍受的：男人没有女人，没有希望，既没有现在也没有将来。蒂沃利花园也不能挽救直线｛文｝下降的士气。高级军官公｛人｝开咒骂拿破仑，甚至当着｛书｝军队的面；结果导致拿｛屋｝破仑最忠诚的年轻副官朱诺为维护拿破仑的名誉和倒霉的诽谤者拉尼斯（Lanusse）之间一场生死决斗，幸好没有致命。
贝尔蒂埃继续思念他的意大利情妇，变得憔悴不堪。拿破仑起先感到可笑，后来不得不引起注意。同时，亚历山大的卫戍司令芒斯库特（Manscourt）将军果然不出众人所料被证明是个极其无能的总督。最后拿破仑不得不将他革职，让梅努取代他（芒斯库特因祸得福，凭着医生的证明，得以回到法国，受到批评他无能者的嫉妒）。迪马将军也批评埃及战役的荒唐和指挥的无能，结果遭到拿破仑一顿谴责。“你在背地里对别人说了许多动摇军心的话，”他训斥这位身强力壮的骑兵军官道，“当心，你可不要逼得我把你军法伺候啊！你那血肉之躯救不了你受枪毙的惩罚！”后来，迪马也被允许回国，从此再没有在法国军队里服役。拿破仑从来就不会轻饶“背信弃义者”。拿破仑的副官、他的弟弟路易，本来在军中应前途不可限量，现在却变得十分忧郁，患上了慢性抑郁症，成了一个对谁都没有用的人。为避免精神反常的弟弟在军中造成的不利影响，拿破仑也将他送上一艘安全通过英国人封锁的帆船回国去了。
要求遣返的军官数量变得越来越多，正如布列纳说的那样：
所有落到总司令手中的信件（他截获军官的家信从来不受良心的谴责）都是异口同声的抱怨和悔恨……在埃及的人没有一个会否认他们的悲惨处境的，这是不可否认的事实。
这在整个法国军队的历史上可能是绝无仅有的：所有的军官都后悔来到这里并要求回家。这成了拿破仑军事生涯中的一个转折点，使他越来越不信赖自己人（他们也不信赖他），其影响在数年后都没有消除。拿破仑竭力阻止这种情绪的蔓延，拒绝了所有军官的回家要求。他认为只有这样才能稳定军心。如果说他当初恩准克莱贝尔将军回国的话，整个远征军无疑会发生反叛或解体。
拿破仑这种维持军心的行为得罪了不少人，大部分军官都聚集在具有同情心的医疗队军官德热内特医生周围——他现在和大家一样非常蔑视拿破仑，若不是医生的职责需要他留下的话，他肯定会毫不犹豫地离开埃及。主医官拉雷的情况也是如此，在和拿破仑为医院的条件以及为退役回家的伤残士兵发放医生证明方面的问题大吵一架之后，总司令部和医疗队的关系迅速恶化（次年，拿破仑离开埃及时将德热内特医生和拉雷留在埃及，以此作为报复）。
尽管拿破仑严令不准退役回家，一位有才能的炮兵军官格罗伯特还是在医生的帮助下成功地获得了回法国的医生证明，拿破仑痛斥这个想逃脱自己魔爪的军官为“懦夫、叛徒和毫无责任感的人”。于是，拿破仑加强了发放准许回家的医生证明的控制。同时，拿破仑绝不允许自己的军队里充斥着满腹牢骚和游手好闲的人，他说这样的人是“不愿以军人为荣者。让他们离去吧。我甚至会为他们大开方便之门，但我绝不允许他们以装病的手段来试图摆脱在这里和我们大家同甘苦共患难的命运”。正因为拿破仑的这种观点，在发现军需官索西贪污欺诈的罪行之后，拿破仑立即将他遣返了。拿破仑还将索西的情况通报了全军，认为这有利于使士气低落的军队为之一振。至于已经将行李运到亚历山大的格罗伯特团长，拿破仑亲手撕碎了他的医生证明，将他发配到多马丁将军驻守的凄凉的萨尔赫亚边远前哨。
当得知拿破仑亲手撕碎了自己开的证明时，德热内特医生执意要到司令部去见拿破仑，结果导致一场激烈的争论，这是拿破仑很不习惯的。正如他在处理克莱贝尔和迪马将军的问题时一样，医疗队的军官和拿破仑之间的关系也再不能恢复到原来的程度了。总司令每天都在堵死自己的后路。
虽然拿破仑继续信任蒙日，但他在自己可能带上少数心腹离开埃及回法国的问题上，还是对蒙日有所保留的。拿破仑将这件事对蒙日透露了多少，我们不清楚。无疑，蒙日非常清楚地知道约瑟芬与夏尔闹得满城风雨的丑闻使她的丈夫成了东方军中许多下流玩笑的目标。他也知道将军之所以要炫耀他和波利娜·富雷丝的关系是为了报复�