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最重要的是，国家或云国家的雏形于此时期在日本诞生了。公元57年，东方海岛上有一个名叫“奴国”的国家，派使节来到东汉都城雒阳朝贡，受光武帝赐予“汉委奴国王印”。据使者称，他的故乡名叫“倭”，其上百余国，奴国在最南端。“委奴国”，就是“倭地之奴国”的意思，这方金印，于十八世纪出土于日本九州北部博多湾口的志贺岛，证明了中国史书中所记载的这一事件的真实性。
107年，又有倭国王帅升进献汉安帝“生口”〔即奴隶〕一百六十人。而至于这个倭国是否前此的奴国，那就没有人知道了。238或239年，倭地又有女王卑弥乎派使者难升米前来朝觐魏明帝，魏明帝封卑弥乎为“亲魏倭王”。
据使者难升米等人叙述倭地的状况，称大小国家林立〔与中国有联系的三十余国〕，其中最大的名为邪马台。邪马台本为男王治国，男王死后国中大乱，最后豪族们共推一名巫女担任国王，就是女王卑弥乎。据说邪马台国尊卑有序，人们被划分为“大人”、“下户”〔平民〕、“生口”和“奴婢”四个等级，此外还有官职，有集市，有租赋，有刑罚，已经具备了完整的奴隶制国家形态。
其后的243年，卑弥乎再派使节赴魏。247年，更派载斯乌越到魏国的带方郡，诉说狗奴国王卑弥弓呼无理相攻，带方太守派张政等奉命持诏前往调停战事。中国史书上记载，卑弥乎去世后，国中立一男王，诸豪族不服，互相攻伐，后改立女王壹与，众人乃平。248年，壹与派人护送张政归国，并进献生口和财帛。
邪马台国究竟在古代日本的哪一地区呢？目前史学界并存着两种意见，一说其在北九州，因为这里文化发展最早，并且具备与大陆地区产生交流的最便捷途径，二说其在近畿地区，因为最终统一日本的大和王朝，就产生于此地区。
邪马台确实也可用中文写作“大和”，但这并无法说明两者一定存在着承继关系，因为“大和”也同样可写作“大倭”。无论邪马台国，还是最初的大和王朝，或许这两者都并非他们正式的国号，只是为了在与大陆交往的过程中体现自己才是日本列岛的主人，才是“大倭”的真正统治者，他们才会自称邪马台，或者大和的。
●出云的神话体系
神话传说中提到，天安河立誓之后，须佐之男就赖在高天原不走了，不仅如此，还到处捣乱，搞得姐姐天照非常头疼。最终，须佐之男把织机房的天棚打开一个大洞，把剥了皮的斑马扔了进去，正在织布的织女惊恐中被机梭击伤阴部而死。天照因此感到害怕，躲进天之岩户，再 也不肯出来了。
机梭、马皮、织女，这些要素不能孤立来看，它是先民对养蚕织锦技术诞生的一种曲折反映。中国古代神话中也有类似故事，是说一名女子爱上了家养的骏马，其父大怒，将马杀死并剥下了皮，而那女子晚间去马尸旁哀悼，却被马皮包裹，化而为蚕，口吐细丝——据说这就是桑蚕的由来，蚕神也因此被叫做“马头娘娘”。
回过头来再说天照，她统治着高天原也即天界，本身由伊邪那歧左眼化出，乃是太阳神。她一躲藏起来，光明立刻消逝，四周漆黑一片。诸神惊惧，前去请教高御产巢日神的儿子思金神。思金神让他们找来报晓的长鸣鸡，并且准备了镜、玉等各种法器，最后由天宇受卖命在天之岩户前歌舞，诸神高声谈笑，以引诱天照出来。
天宇受卖命跳的是什么舞呢？据说她身穿盛装，手持一束细竹叶，站在倒扣的木桶上，掏出乳房，松散裙带，暴露阴部，狂舞不休——这简直是脱衣艳舞，但对于注重生殖崇拜的先民来说，或许是相当虔诚并且具有魔力的一种祈神的舞蹈吧。
天照听到外面的歌舞声，欢笑声，感到非常奇怪，自己躲进天之岩户，外面应该一片漆黑，众神还有心思欢聚吗？她偷偷伸出头来观看，却被躲在门口的天手力男神一把拽出，于是天宇重获光明。事后，众神决定惩罚须佐之男，没收他的全部财产，割去胡须，拔去手指甲和脚趾甲，驱逐出高天原——这种刑罚，据考证在日本历史上真的存在过。
离开天界的须佐之男，不知道是否痛悔过往所为，他此后的行径和各神话中杀妖救民的半人半神的英雄毫无两样。首先，他杀死了抢吃少女的八俣大蛇，并且从蛇尾中获得了都牟刈大刀，将其献给姐姐天照——这就是日本皇室三宝中的草薙剑。
其后，须佐之男来到出云国〔今日本国本州西部〕定居，在此建造了须贺宫殿。他先后娶了栉名田比卖和神大市比卖两个妻子，生下一大堆小孩。顺便提一下，“比卖”或“毗卖”，《日本书纪》中用中文写作“姬”或“媛”，有此后缀的人名，都是指的女性，并且是身份比较高贵的女性。
正如上面所说，古代日本诸国林立，神话传说也纷纭复杂，所谓“八百万诸神”，乃是后世为了政治需要将各地方豪族所供奉的神灵统合起来，而产生的数量非常可怕的名词。基本上，“弥生时期”和其后的“古坟时期”，日本文化的三大焦点，也是神话传说的三大来源，乃是北九州、畿内和出云〔近世又发现了似与出云同源的吉备文化〕。无疑须佐之男及其后继者大国主的神话是属于出云系的，而天照的神话则出于大和系——至于大和系属于北九州还是畿内，正如大和王朝的来源一样，史学界也还在争论不休。
大国主神本名大穴牟迟，一说是须佐之男的孙子，一说是他孙子的孙子的孙子。这位大穴牟迟性格温和，因此经常受到兄弟们的欺负，尤其当他抢先所有兄弟娶到了稻羽〔因幡国〕的美女八上比卖后，更是遭到嫉恨。兄弟们先是引诱他去捕捉红色野猪，然后把烧红的石头从山上滚下，将其活活烫死，然后又引诱他进入一株开缝的枯树，然后突然拔去支撑的楔子，把他活活夹死。两次死亡，都亏其母刺国若比卖施展神通，或者请求神助，救活了他的性命。
大穴牟迟因此被迫逃亡，最终遇见了须佐之男的女儿须势理毗卖，两人产生爱情，结为夫妇。然而须佐之男似乎对此婚姻大不满意，称大穴牟迟为“苇原色许男”，意为“苇原中国〔人界〕的粪便男”。他多次想要害死大穴牟迟，但每次女婿都在女儿的帮助下险险逃脱。最后大穴牟迟趁须佐之男熟睡的时机，偷了丈人的刀、弓和天沼琴，带着妻子仓皇逃走。须佐之男醒来后追赶不及，在后面大叫说：“你用我的大刀和弓箭，去伏击并杀死你的那些异母兄弟，你就能成为统治苇原中国的大国主神！”
从最后这句喊话来看，似乎须佐之男并不是真的想杀死女婿，而只是想让他吃点苦头，受点磨练。世界各国神话中，这种英雄人物少年时代经历坎坷，甚至受到亲人的迫害，被母亲或妻子拯救，最终成就大业的事例倒也不在少数。总之，大穴牟迟遵从丈人的指示去做，终于成为日本的统治者，或者不如说，成为出云地区的统治者，他此后也被称为大国主神、八千矛神，或者宇都志国玉神。
●大和的神话体系
出云神话的辉煌期到此终结，以后要让位给大和系的神话，也即天照大神及其子孙。也不知道怎么一来，天照突然觊觎起地上的国土来了，她对儿子正胜吾胜胜速日天忍穗耳命〔天安河立誓时从十握剑中生出的诸子之一〕说：“富饶的苇原中国，应该由你来统治。”于是派遣诸神下界去向大国主讨取。大国主当然不会答应，几拨使者都有去无回，最后天照派下了建御雷和天鸟船前往。
建御雷神是个大力士，大国主最有名的两个儿子，八重事代主没敢放对就认输了，建御名方打了一场，大败亏输，一直逃到日本中东部的诹访，差点被杀，也只好答应建御雷的要求。于是大国主提出条件，要天神们为他在出云国建造宏伟华丽的宫殿，让他永远接受祭祀，然后体面地退隐了。
这就是所谓的“让国传说”，在此传说中，大国主曾经的英风侠气一扫而空，凡事都要听取儿子们的意见，而他的儿子也不成器，最终输掉了国家。这段传说中会隐藏着真实的历史吗？某些学者认为，那象征着来自北九州的大和族征服出云地区，而另一派学者则认为它完全是因政治需要而生造出来的西贝货。
建御雷完成使命，回归天界汇报战果，但正胜吾胜胜速日天忍穗耳命却不肯下凡，他推荐自己的次子天迩岐志国迩岐志天津日高日子番能迩迩艺命。于是这位名字冗长的天神之子就来到九州南部的筑紫地方，在高千穗峰立都建国——但他只被称为“天孙”或“天神御子”，还不是初代天皇。
其实天皇的名号来源很晚，日本古代君主多称大王，要到七世纪以后才给古代的大王们上谥号，改称某某天皇。中国史书中就记载着五位大王，名字分别为赞、珍、济、兴和武，日本学者认为，他们可能分别对应着传说中的仁德、反正、允恭、安康、雄略五位天皇。这倭五王时期，大致应为公元413年到500年，中国正当东晋南北朝时代。
日本从三世纪末进入了“古坟文化时期”，以大和地区为代表，各地都出现了大量的高冢式坟墓，是此时期得名的由来。许多古坟占地面积广大，内藏殉葬品数量惊人，说明日本的奴隶社会已经迈入了成熟期。
约可对应古坟时代前中期，神话中出现了神武天皇东征的故事。这位天皇名叫神倭伊波礼毗古命，他和其兄五濑命二人决定向东方发展，于是先北上，从北九州渡海到了安艺地方，在这里停留了一段时间后，继续乘船东进，得到吉备地区住民的帮助，驶向本州中部。在与摄津地区的统治者登美能那贺须泥毗古的战争中，五濑命中箭而死，神倭伊波礼毗古命被迫南下绕路，得到熊野的高仓下的帮助，终于从纪伊上岸，进入了内陆地区。
一路厮杀——虽然神话传说中这种厮杀多为古代英雄们的单打独斗——最终神倭伊波礼毗古命来到大和地区，就在这里建都，并且娶妻生子，开始繁衍蕃息。神倭伊波礼毗古命就是大和王朝的初代天皇，称“神武天皇”。某些学者认为此神话是来自九州的大和族长途迁徙并且征服本州中部的象征，虽然其间掺杂太多不可解甚至不可理解的因素，但远行路线基本不差。当然，也有学者认为那也是完全的西贝货，根本相信不得。
不管大和王朝的来源为何，是北九州、南九州，还是大和本土，它与前此的邪马台国是否有所渊源，总之，这个王朝从此就屹立在日本本州的中部，绵延流传直到今天。日本人因此经常宣传自己的天皇血统纯正，“万世一系”——不过，越来越多的人逐渐不再相信这种天真的谎话，我们今天唯独能确定的，是大和王朝从四世纪时崛起，它或者它的继承者逐步统一了日本列岛，并且它或者它的继承者，以后一直延用“ 大和王朝”这个名称，并且把各自的系谱篡改缝合到了一起。
据说神武天皇后的第十世为崇神天皇，他曾派大毗古命征服了北陆地方，派建沼河别命征服了东海道十国，派日子坐王征服了丹波地区，逐步统一除东北外的本州岛。再传两世为景行天皇，�