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不久以后，毛利、宇喜多联军又击败三浦氏，此时三备地区剩余的亲织田势力就只有宇喜多直家的主家浦上宗景了。天正五年（1577年），浦上氏同族久松丸发动叛乱，直家趁机施计攻取浦上本城——难攻不落的天神山城，浦上宗景被迫隐居。
●贱之岳合战
宇喜多直家是在羽柴秀吉的一再努力说服下，才于天正七年（1579年）十月归顺于织田信长的，就在同月，明智光秀上报平定了丹波、丹后二国。其后不久，直家就病逝了，遗命其子八郎继承家督之位。八郎年龄还小，直家就请求羽柴秀吉收八郎为养子，拜领“秀”字，起名为宇喜多秀家。
有了宇喜多氏相助，羽柴秀吉在东中国地区更是如鱼得水，屡战屡胜。天正十年（1582年）他水淹高松城，五月二十一日，毛利氏当主毛利辉元亲统大军到达高松城外，却被河水阻隔，无法前进，只能将本阵设在高松以西二十公里的猿挂城中。真正在前线与羽柴秀吉对峙的乃是“毛利两川”——吉川元春和小早川隆景。
本能寺之变的同时，水淹高松已经到了最后关头。高松城守将清水宗治提出以自己一人切腹来挽救全体部下的性命，羽柴秀吉也答应说，只要得到宗治的首级，好让他对织田信长有个交代，他就立刻退兵。就在此时，秀吉得到了本能寺之变的消息，他暗中收拾行装，做好退兵打算，明里却好整以暇地等待宗治自杀。六月四日，清水宗治乘一叶小舟来到两军阵地中央，随即在舟中切腹。
在与毛利军交换停战文件后，羽柴秀吉匆匆挥师东归。就在此时，毛利方也得到了本能寺之变的消息，吉川元春主张挥师追击羽柴军，然而足智多谋的小早川隆景却说：“秀吉不仅是智勇双全的大将，并且怀有天下大志，如果我们违誓，他必恨之入骨，恐非吾家之福。”拦住了元春。
就这样，羽柴秀吉快速赶回近畿，在山崎击败明智光秀，从而在其后的清洲会议中掌握了主动权，拥有了重要的砝码。织田家中二分以后，织田信孝为了篡夺家督之位，靠拢和利用柴田胜家，甚至做主将自己的姑母市姬（原为浅井长政之妻）也嫁给胜家。在柴田胜家从北方向羽柴秀吉施压的同时，泷川一益也煽动伊势长岛一揆在南方捣乱。
就在清洲会议的次年（1583年）年初，羽柴秀吉出兵进攻长滨城主柴田胜丰。柴田胜丰本是柴田胜家的养子，有望继承家督之位，然而胜家更宠爱自己的外甥、另一名养子佐久间盛政，这使胜丰寝食难安。在这种心理压力下，加上羽柴军大兵压境，胜丰遂开城出降——羽柴秀吉拔掉了自己身边的一枚钉子。
羽柴秀吉所以敢于大胆进兵，是因为当年北陆地区又降下大雪，柴田胜家被困北之庄城中无法动弹。然而胜家确实悍勇，他闻讯后集结兵马，竟然铲雪前进，于三月十日开到了北近江的柳之濑地方。十二日，北陆各家兵马陆续集结，总势两万余，胜家在内中尾山立下本阵，佐久间盛政在行市山，前田利家在别所山，皆在本阵之南。
十七日，羽柴军大约五万也开到了柳之濑南方、琵琶湖畔的木之本。羽柴秀吉命令其弟秀长屯兵田上山，堀秀政屯兵左弥山，中川清秀屯兵大岩山，高山重友屯兵岩崎山，桑山近晴屯兵贱之岳——大半都是山崎合战时候的老同僚，现在变成了新部下。
羽柴军兵马众多，但所处地势较为低洼，柴田军兵数虽少，却占有地利之便，因此两军对峙一个多月，谁都不敢抢先发起进攻。四月中旬，羽柴秀吉伪作主力东移，前往讨伐美浓岐阜城的织田信孝。四月二十日，佐久间盛政认为战机来到，不遵柴田胜家之命而妄自发兵，绕过余吴湖，从侧面进攻羽柴军前阵。结果大岩山、岩崎山阵营瞬间就被攻克，中川清秀战死沙场。
同时，佐久间盛政的副将柴田胜政也进攻贱之岳，眼看就要得手，却被渡琵琶湖赶来增援的丹羽长秀军击退。前军伸出如此之远，不由得柴田胜家不动，于是胜家下了内中尾山，前进至柳之濑旁的狐塚，前田利家则进至余吴湖北的茂山。
消息在当日午后就传到羽柴秀吉耳中，于是二时左右，正在美浓国大垣城附近的秀吉命令大军掉头，全速前进，当晚九时就赶回了木之本。大垣和木之本之间距离为52公里，＇奇＋书＋网＇竟然只行军了七个小时（另一说是下午四时动身，则只跑了五个小时），这不能不说是一个奇迹。
次日天还没亮，羽柴秀吉就对正在大岩山和岩崎山上休息的佐久间盛政部队发起猛攻。佐久间盛政不敌后退，在贱之岳附近遭到夹击，溃不成军。据说当时有七名秀吉麾下的年轻武士在战斗中立下大功，被后世称为“贱之岳七本枪”，他们是：加藤清正、福岛正则、糟屋武则、片桐且元、加藤嘉明、平野长泰和胁坂安治。
且说羽柴军追击败退的佐久间盛政，一路向北，还没等遭遇到茂山上的前田利家势，前田军就先自撤退了。前田利家是尾张国的豪族出身，一般认为，他和羽柴秀吉素来交好，因此不愿与秀吉交战，但也很可能是事先与秀吉达成过某种密约——这从战后秀吉将北陆大片领地封赠给利家，就可看出来了。
非止前田利家一人，金森长近等暂隶柴田胜家麾下的织田家将领也纷纷退却，牵动中军，就此全面崩溃。佐久间盛政在逃跑途中被擒获，处以磔刑，而柴田胜家则在回归主城越前的北之庄后，被羽柴军团团围困，无奈之下和妻子市姬登上天守阁，对刺而死，同时引燃火药，炸了个尸骨无存。当年五月，织田信孝逃到尾张的内海地方，也自杀了，泷川一益降伏。
经过贱之岳合战，历史就此由织田信长的安土时代，迈入了丰臣（羽柴）秀吉的桃山时代。
●小牧·长久手之战
清洲会议以后不久，羽柴秀吉就在京都为故主织田信长举行了规模宏大、仪式隆重的葬礼——当然，信长早已尸骨无存了，只好做个衣冠塚——以下天下人表明，他才是真正信长事业的继承人。其后秀吉又在贱之岳战胜最强有力的竞争对手柴田胜家，并逼死织田信孝。天正十一年（1583年）八月，羽柴秀吉重新分封诸将领地，把织田系的武将泰半纳入自己麾下，这一举动激怒了一个人，那就是织田信长的次男织田信雄。
贱之岳合战的时候，织田信雄在尾张国作壁上观，他很希望羽柴秀吉打败柴田胜家和织田信孝，从而使自己距离织田家督更近一步，最不济也可以混个三法师的后见当当。然而秀吉在战胜后却根本没有尊奉信雄的打算，于是信雄联合东方的德川家康，于天正十二年（1584年）三月宣布与秀吉绝交。
羽柴秀吉视织田信雄如同草芥，但他不能不顾虑势力日益膨胀的德川家康。家康原领有三河、远江两国，灭亡甲斐武田氏以后又拿到了骏河一国。本能寺之变的时候，家康与武田氏降将穴山梅雪斋信君应织田信长的邀请上洛，在安土、京都停留一段时候后，正转向堺市游览。噩耗传来，他立刻逃回老家三河。
据说德川家康首先进入伊贺国，他手下的重臣服部半藏正成本源于伊贺三上忍，就临时招募伊贺残党来保护家康的安全。当时畿内一片混乱，一揆、落武者狩到处皆是，全靠了这些落难忍者的卫护，家康才得以安全回归本领。穴山信君就倒霉得多了，逃亡途中被落武者狩所杀。
一回到自己的根据地，德川家康立刻毫不犹豫地发布了动员令，不过他的目标并非上洛去讨伐明智光秀，反而进军因为本能寺之变而乱成一锅粥的织田氏甲信领地。当时甲斐领主河尻秀隆为一揆所杀，信浓守将森长可等都已驰援畿内，这一大片无主之地瞬间就被家康一口吞下了。不仅如此，他还收编了很多武田氏的残党，军力越发雄厚——因此德川氏其后参与的战争，很多方面都延续了武田信玄的兵法原则。
德川家康多年蛰居于织田信长之下，信长既死，平定天下原不作第二人想，没料到羽柴秀吉三不知跳了出来，只花了一年的时间，就基本上收纳了织田家的所有领地，这使家康大为恼火。正好织田信雄送来同盟书信，家康就以支援信雄为藉口，发兵西向，讨伐秀吉。
天正十二年（1584年）三月开始，双方在小牧和长久手两个地区展开战斗。小牧，即织田信长的旧主城、尾张小牧山城。三月七日，德川家康从主城滨松出发，很快进入织田信雄的根据地尾张清洲城，德川、织田联军总数三万余。羽柴秀吉集合八万大军从北方进入尾张国，很快就攻克了犬山城。
德川家康在小牧山附近筑起蟹清水、北望山等砦，严密防守，而羽柴秀吉也在犬山和小牧山之间的二宫山地修筑内久保山、外久保山、小松寺山等砦相抗。双方数度接触，羽柴军仗着人多势众，一开始略占优势，羽柴秀吉也干脆把本阵从犬山城转移到二宫山麓的乐田城中。
对峙到四月六日，羽柴秀吉焦躁起来，打算出一支奇兵从战线东侧秘密南下，切断德川家康与其三河老家的联系，则德川军即可不战而败。这本是一步妙棋，然而用人不当却使策略彻底失效，不仅如此，还斩断了秀吉的臂膀，从而丧失了彻底消灭德川势力的可能性。且说秀吉派其养子羽柴秀次为总大将，池田恒兴、森长可、堀秀政为副将，率军两万南下。作为奇袭部队来说，这两万人的数量也未免太大了，消息很难不被泄露，因此奇袭军也分为两路，总大将羽柴秀次在西，随时戒备德川军的动向，池田恒兴等人在东，希望能够尽快攻克边境附近的岩崎城，突入三河国。
奇袭军是四月六日半夜出发的，次日一早，德川家康就得到了消息，他派大将榊原康政前往追击，并且自己于八日晚间也秘密离开小牧山城，亲率近万兵马前往增援。四月九日凌晨时分，羽柴秀次军行动迟缓，还驻扎在本阵乐田城东南二十多公里外的白山林中，前锋池田恒兴等人倒已经杀至岩崎城下。四时左右，德川军突然对秀次军发动奇袭，羽柴秀次年纪很轻，没有战斗经验，短短两个小时就被兵力稍弱于己的德川军击溃了。
羽柴秀次逃回乐田城，副将堀秀政则收拢残部，在白山林东南方的长久手地方构筑工事，想要挡住德川军，以掩护正在攻打岩崎城的池田恒兴部。七时左右，德川大军挟着战胜之势南下长久手，堀秀政战败退却。直到这个时候，岩崎城下的池田恒兴、森长可才得到消息，匆忙回身来战，却已经来不及了。九时左右，德川军猛攻池田恒兴部，池田恒兴、森长可全都战死——森长可是织田家谱代重臣，当年在近江宇佐山城战死的森可成是他的父亲，在本能寺为保护织田信长而被杀的森兰丸是他的兄弟。
因为长久手战斗的胜利，德川军士气如虹，羽柴秀吉更不敢再贸然发动进攻了，就这样，他竟然被兵力小弱于自己的德川家康牵制在尾张境内，一直对耗到当年冬天。不过羽柴秀吉并没有在前线闲着，他利用威逼、利诱等种种手段，于当年十一月十一日终于说服织田信雄签下合睦文书。失去了拥戴信雄的大义名份，德川家康也就只�